93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6996 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6996  stress protein  100 
 
 
402 aa  815    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  30.75 
 
 
402 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  30.75 
 
 
401 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  32.28 
 
 
401 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  28.36 
 
 
401 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  25.35 
 
 
398 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  31.07 
 
 
528 aa  80.9  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  32.1 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  29.24 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  29.24 
 
 
194 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  23.99 
 
 
432 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  28.65 
 
 
194 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  28.65 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  28.65 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  28.65 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  28.65 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  28.65 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  28.65 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  28.65 
 
 
194 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  28.07 
 
 
194 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  32.16 
 
 
192 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  28.26 
 
 
191 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  29.8 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0119  stress protein  27.27 
 
 
418 aa  60.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  29.32 
 
 
689 aa  59.7  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  30.83 
 
 
186 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  30.1 
 
 
191 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  33.98 
 
 
191 aa  57.4  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  28.82 
 
 
222 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  27.65 
 
 
191 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  27.65 
 
 
191 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  27.65 
 
 
191 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  28.42 
 
 
191 aa  57  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  26.67 
 
 
192 aa  56.2  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  32.04 
 
 
191 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  28.95 
 
 
191 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  29.32 
 
 
192 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  28.27 
 
 
191 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  29.94 
 
 
560 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  33.33 
 
 
493 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  26.34 
 
 
205 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  26.74 
 
 
193 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  29 
 
 
192 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  29.51 
 
 
191 aa  51.2  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2996  stress protein  26.5 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0312721  normal  0.678012 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3023  stress protein  28.45 
 
 
188 aa  51.2  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102186  hitchhiker  0.000574983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  28.65 
 
 
191 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  27.46 
 
 
191 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  28.23 
 
 
191 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  27.06 
 
 
191 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  27.46 
 
 
191 aa  50.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  31 
 
 
191 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  31.06 
 
 
568 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  32.63 
 
 
479 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  27.65 
 
 
192 aa  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  35.29 
 
 
248 aa  50.1  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  28.69 
 
 
191 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  28.07 
 
 
192 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  29.29 
 
 
192 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  26.4 
 
 
192 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  28 
 
 
192 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  34.78 
 
 
218 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  29.13 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  29.29 
 
 
191 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  25.44 
 
 
192 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  26.47 
 
 
191 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  26.32 
 
 
191 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  41.94 
 
 
418 aa  46.6  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  28.16 
 
 
191 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  26.36 
 
 
190 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  32.35 
 
 
191 aa  46.2  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  27.17 
 
 
192 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  24.57 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  24.57 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  25.55 
 
 
385 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  24.57 
 
 
394 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  26 
 
 
191 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  28.71 
 
 
191 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0824  stress protein  28.43 
 
 
189 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  24.26 
 
 
192 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  35.29 
 
 
545 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  24.26 
 
 
192 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  24.26 
 
 
192 aa  43.9  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  32.97 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  33.33 
 
 
225 aa  43.5  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  27.06 
 
 
192 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  32.37 
 
 
413 aa  43.5  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  22.59 
 
 
402 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  31.3 
 
 
233 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  24.71 
 
 
192 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0767  stress protein  25.53 
 
 
202 aa  43.1  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0761  tellurium resitance protein TerZ  25.53 
 
 
202 aa  43.1  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228615  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  43.59 
 
 
428 aa  42.7  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>