More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2999 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2999  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  971    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.280207  normal  0.727721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  76.22 
 
 		 574 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5679  protein of unknown function DUF21  61.52 
 
 		 450 aa  471  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1722  protein of unknown function DUF21  52.79 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2720  hypothetical protein  55.04 
 
 		 451 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  53.23 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2378  protein of unknown function DUF21  51.44 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000393714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  50.61 
 
 		 486 aa  381  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  49.18 
 
 		 490 aa  380  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  53.72 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0508  protein of unknown function DUF21  53.17 
 
 		 451 aa  376  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  50.46 
 
 		 444 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  51.09 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2643  hypothetical protein  48.67 
 
 		 445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  47.29 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  46.07 
 
 		 461 aa  348  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  47.33 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3094  hypothetical protein  48.24 
 
 		 451 aa  346  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.292492  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2814  hypothetical protein  47.13 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  45.67 
 
 		 438 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2858  hypothetical protein  47.13 
 
 		 471 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.860129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2841  hypothetical protein  47.13 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3364  hypothetical protein  47.47 
 
 		 457 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  49.23 
 
 		 474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07750  CBS domain-containing protein  47.62 
 
 		 438 aa  339  8e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  45.98 
 
 		 452 aa  338  9e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  45.18 
 
 		 442 aa  336  7e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11870  hypothetical protein  45.92 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0136182  normal  0.440152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3662  hypothetical protein  44.29 
 
 		 453 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0063  protein of unknown function DUF21  45.02 
 
 		 452 aa  320  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  41.85 
 
 		 520 aa  289  6e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1409  hypothetical protein  42.4 
 
 		 452 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.464754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1368  hypothetical protein  40.83 
 
 		 452 aa  282  8.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4665  protein of unknown function DUF21  40.49 
 
 		 441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24020  CBS domain-containing protein  40.92 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.94366 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  35.66 
 
 		 446 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6909  hypothetical protein  39.85 
 
 		 451 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1685  CBS  40.44 
 
 		 462 aa  247  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  35.51 
 
 		 446 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3490  hypothetical protein  38.56 
 
 		 458 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0119  protein of unknown function DUF21  40.41 
 
 		 486 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.22 
 
 		 437 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 		 431 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3477  hypothetical protein  38.31 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3540  hypothetical protein  38.31 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05880  CBS domain-containing protein  39.21 
 
 		 478 aa  240  4e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.927545 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.9 
 
 		 442 aa  236  8e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0445  protein of unknown function DUF21  39.5 
 
 		 451 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0534885  normal  0.0812429 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1941  protein of unknown function DUF21  38.92 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.164047  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5779  protein of unknown function DUF21  41.44 
 
 		 468 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0318  protein of unknown function DUF21  36.68 
 
 		 496 aa  231  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000206585  hitchhiker  0.00828276 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.92 
 
 		 438 aa  231  3e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  31.95 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.18 
 
 		 446 aa  230  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  36.06 
 
 		 446 aa  226  6e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  36.06 
 
 		 433 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0412  protein of unknown function DUF21  38.24 
 
 		 459 aa  223  7e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29322  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2683  CBS domain-containing protein  38.82 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.522065  normal  0.368276 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2949  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 		 469 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2793  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 		 464 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  33.82 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3860  hypothetical protein  36.72 
 
 		 453 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.188072  normal  0.0935065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  30.23 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.3 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.3 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.3 
 
 		 442 aa  213  9e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.07 
 
 		 442 aa  213  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.69 
 
 		 443 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.07 
 
 		 442 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  30.9 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.46 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.46 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.46 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.31 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.46 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.46 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  36.12 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  29.6 
 
 		 442 aa  211  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.63 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.22 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  29.6 
 
 		 442 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.22 
 
 		 435 aa  209  8e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.03 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  31.53 
 
 		 451 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  30.56 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  31.29 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  31.29 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  29.63 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  31.44 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  31.19 
 
 		 443 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  30.87 
 
 		 464 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0015  protein of unknown function DUF21  36.18 
 
 		 450 aa  207  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.309554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 		 435 aa  207  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  34.53 
 
 		 443 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 		 428 aa  206  9e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  36.02 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>