More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1801 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1801  aldo/keto reductase  100 
 
 		 394 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.672115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2604  aldo/keto reductase  85.67 
 
 		 366 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3654  aldo/keto reductase  58.24 
 
 		 350 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.504649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4586  aldo/keto reductase  31.52 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00281248  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1004  aldo/keto reductase  30.92 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0837346  normal  0.566721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1156  aldo/keto reductase  30.72 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0623  aldo/keto reductase  26.22 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0638  aldo/keto reductase  26.22 
 
 		 312 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3216  aldo/keto reductase  24.28 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  28.06 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  27.86 
 
 		 314 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  27.93 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0244  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.17 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  27.19 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  27.19 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1275  aldo/keto reductase  28.87 
 
 		 315 aa  107  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.13271 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.19 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  27.14 
 
 		 336 aa  106  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0539  aldo/keto reductase  29.74 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0553  aldo/keto reductase  29.74 
 
 		 324 aa  106  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0909264 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2495  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.19 
 
 		 326 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2655  aldo/keto reductase  28.74 
 
 		 309 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.841541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2866  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  28.32 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1855  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.19 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0511443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  26.9 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.9 
 
 		 326 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2056  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.15 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0299722 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2428  D-threo-aldose 1-dehydrogenase  27.75 
 
 		 308 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.466791 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3323  aldo/keto reductase  28.77 
 
 		 335 aa  100  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  25 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  29.25 
 
 		 316 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  26.7 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  26.29 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0283  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 315 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  26.58 
 
 		 347 aa  99  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2804  aldo/keto reductase  27.03 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2287  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 330 aa  98.2  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000438369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1866  aldo/keto reductase  23.72 
 
 		 311 aa  98.6  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  28.07 
 
 		 319 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2080  aldo/keto reductase family oxidoreductase  23.12 
 
 		 311 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0058504  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2116  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  24.62 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.638189  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1059  aldo/keto reductase  27.06 
 
 		 327 aa  97.8  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1479  putative oxidoreducatse  27.84 
 
 		 326 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0036  aldo/keto reductase  25.68 
 
 		 314 aa  97.1  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  23.95 
 
 		 319 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1811  aldo/keto reductase  25.14 
 
 		 316 aa  96.7  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1282  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02650  aldo/keto reductase  26.29 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0423  aldo/keto reductase  28.78 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0304393 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  27.7 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2022  aldo/keto reductase family oxidoreductase  28.21 
 
 		 317 aa  94.7  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.37723  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2093  aldo/keto reductase  27.57 
 
 		 322 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  24.71 
 
 		 306 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3763  aldo/keto reductase  26.49 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.866751  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  25.53 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1279  aldo/keto reductase  25.07 
 
 		 339 aa  94.4  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0530409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  24.77 
 
 		 319 aa  94  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  23.24 
 
 		 319 aa  94  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  25.14 
 
 		 336 aa  94  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3557  aldo/keto reductase  29.06 
 
 		 335 aa  93.6  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.729958  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  25.68 
 
 		 314 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1861  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.52 
 
 		 311 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.474884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2003  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.52 
 
 		 311 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2037  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.52 
 
 		 311 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1767399999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2701  aldo/keto reductase  25.74 
 
 		 325 aa  93.2  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.117556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  25.93 
 
 		 333 aa  92.8  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.52 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  22.52 
 
 		 311 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  26.11 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0797  aldo/keto reductase  26.18 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.138873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1815  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.52 
 
 		 311 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.809952  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  23.56 
 
 		 330 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3181  aldo/keto reductase  28.77 
 
 		 322 aa  91.3  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.231147  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  26.95 
 
 		 351 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  25.93 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  25.15 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 327 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  26.65 
 
 		 370 aa  90.5  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3235  aldo/keto reductase  26.52 
 
 		 327 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3505  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49800  oxidoreductase  27.87 
 
 		 329 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0869  putative oxidoreductase  26.55 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  25.71 
 
 		 338 aa  89.7  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1831  aldo/keto reductase family oxidoreductase  22.22 
 
 		 311 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  26.29 
 
 		 336 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3566  aldo/keto reductase  27.33 
 
 		 319 aa  89.4  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0270912  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0748  aldo/keto reductase  28.27 
 
 		 329 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.58635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2875  aldo/keto reductase  25.83 
 
 		 323 aa  89.7  9e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.536931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  25.85 
 
 		 337 aa  89  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  23.58 
 
 		 334 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  25.71 
 
 		 332 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4165  lolS protein  25.59 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0524  aldo/keto reductase  27.73 
 
 		 359 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  27 
 
 		 351 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2138  aldo/keto reductase  23.71 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  26.57 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  25.66 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 319 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3852  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.79 
 
 		 304 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>