15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0247 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  473  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  69.23 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  54.72 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  48.15 
 
 		 244 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  52 
 
 		 250 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  46.81 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  52 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  46.81 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  46.81 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1566  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 		 277 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  45.1 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4262  esterase/lipase/thioesterase  35.71 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4136  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 262 aa  46.2  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  52 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  44.23 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>