37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0868 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  100 
 
 
263 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  50.83 
 
 
261 aa  241  7e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  45.76 
 
 
251 aa  196  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  45.11 
 
 
251 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  29 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  30.14 
 
 
731 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  26.33 
 
 
452 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  27.04 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  27.04 
 
 
387 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  34.68 
 
 
273 aa  82  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  27.04 
 
 
413 aa  79.7  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  33.33 
 
 
244 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  24.49 
 
 
416 aa  78.2  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  33.78 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  29.82 
 
 
235 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  26.53 
 
 
420 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  24.9 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  26.98 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  26.97 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  30.71 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  23.98 
 
 
360 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  23.98 
 
 
360 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  24 
 
 
366 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1114  hypothetical protein  29.41 
 
 
413 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0990251  normal  0.0233772 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  23.23 
 
 
366 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  24.73 
 
 
368 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  28.14 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  23.62 
 
 
363 aa  57  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  22.54 
 
 
357 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  25.49 
 
 
1035 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  21.72 
 
 
361 aa  52.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  24.77 
 
 
365 aa  52.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  25.98 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1075  hypothetical protein  28.08 
 
 
447 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2133  hypothetical protein  26.55 
 
 
903 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.0029443  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1203  hypothetical protein  28.08 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502395  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1134  hypothetical protein  27.78 
 
 
466 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00871122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>