46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0324 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0324  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
102 aa  206  7e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1182  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.65 
 
 
108 aa  90.5  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0128557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1272  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  45.65 
 
 
108 aa  90.5  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.24 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000824  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1837  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  46.15 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0468  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.08 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.3605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.56 
 
 
139 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.03 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.08 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.37 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1764  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.89 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  37.5 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.82 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.89 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.71 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.96 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0337  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.95 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.263925 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.91 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.82 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0744  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.18 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.09 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4617  ATP synthase F1, epsilon subunit  26.74 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.68 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2176  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.68 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0466412  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0177  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.999255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0204  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.09 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2406  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  31.87 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.385305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.73 
 
 
149 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1219  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.55 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1708  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.41 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239436  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  32.5 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.86 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.95 
 
 
138 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.74 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.59 
 
 
140 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3706  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.89 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.89 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.89 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1637  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.89 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  30.38 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2756  ATP synthase F1, epsilon subunit  28.57 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.89 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1025  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.8 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.59 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>