More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0242 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
248 aa  485  1e-136  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.03 
 
 
241 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.397632  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1147  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
244 aa  225  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00218262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
243 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41 
 
 
243 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0340  putative sulfonate transport system permease protein  39.59 
 
 
248 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0856  ABC-type transport system, permease component  28.19 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.376745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.03 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.57 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0565837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0563  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.09 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0273094  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3240  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.11 
 
 
275 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.38 
 
 
252 aa  91.7  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799696  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3901  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.28 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0566341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.02 
 
 
538 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08100  ABC transporter, permease component  25.88 
 
 
528 aa  89.7  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4564  taurine transporter subunit  23.83 
 
 
279 aa  89  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.746145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0442  taurine transporter subunit  24.66 
 
 
275 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0210  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  24.38 
 
 
532 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.45 
 
 
258 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561949  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0391  taurine transporter subunit  24.22 
 
 
275 aa  87  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.65 
 
 
253 aa  87  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.957931  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2358  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  25.89 
 
 
269 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.540869 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0552  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.7 
 
 
286 aa  85.9  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973794  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1380  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  25.1 
 
 
277 aa  85.9  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.32 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.33 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.832577  normal  0.34867 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1347  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  26.03 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000648082  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.30868 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0280  taurine transporter subunit  23.77 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0431  taurine transporter subunit  23.77 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2803  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.09 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.98 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0448966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.84 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0254  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  23.35 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
276 aa  82  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.89 
 
 
275 aa  82  0.000000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.49 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00317  taurine transporter subunit  22.87 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3261  taurine transporter subunit  22.87 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1171  taurine ABC transporter permease  24.54 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.104716  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00321  hypothetical protein  22.87 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.2 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000228451  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3138  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.89 
 
 
286 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.453695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0570948  normal  0.0921514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0149  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.34 
 
 
532 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2535  putative taurine ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.254862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
279 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.33405  hitchhiker  0.000710194 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5321  taurine ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.36 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.78 
 
 
536 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2935  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.05 
 
 
252 aa  80.1  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1679  ABC transporter permease  22.07 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.451747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.7 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0747147  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.61 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0396  taurine transporter subunit  23.77 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3747  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.31 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3936  taurine transporter subunit  22.75 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0260  taurine transporter subunit  22.75 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3693  taurine transporter subunit  22.75 
 
 
284 aa  79  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2776  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.52 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0898999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0520  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.59 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.231998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12960  taurine ABC transporter permease  25.26 
 
 
272 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299757  normal  0.321121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19510  ABC transporter permease  21.6 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0840  taurine transporter subunit  23.29 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.276647 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4420  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.98 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25857  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3459  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.11 
 
 
283 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.703735  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.54 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.588836 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2787  ABC transporter, permease protein  22.86 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0328614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2515  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  22.38 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.313862  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4844  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.54 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7221  ABC transporter membrane spanning protein (nitrate/sulfonates)  24.68 
 
 
282 aa  75.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.735165  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.98 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000270165  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.63 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1998  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.1 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.894639  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.46 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.796344  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.63 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750363  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.63 
 
 
260 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000143494  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2638  ABC sulfonate transporter, inner membrane subunit  24.35 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0950643  hitchhiker  0.0000361652 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  20.99 
 
 
277 aa  75.1  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.589472  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0423  abcb protein  24.4 
 
 
265 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0981  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  24.62 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2712  sulfonate ABC transporter permease  25 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2920  sulfonate ABC transporter permease protein  25 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.2 
 
 
258 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.58 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.55 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1974  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  21.58 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000226251  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0950  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.88 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.123271  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1737  ABC transporter, permease protein  25.47 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0444419  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2851  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.98 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.328809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1078  ABC transporter, nitrate-like  22.69 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193306  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1580  taurine ABC transporter, permease protein  19.56 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0620  permease component of taurine ABC transporter  19.72 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1465  ABC transporter permease  25.94 
 
 
251 aa  72  0.000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  21.9 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0426  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.98 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0423  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.27 
 
 
297 aa  72  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.283538  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2019  taurine ABC transporter, permease protein  19.56 
 
 
285 aa  72  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.484134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>