14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2207 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2207  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.395181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0409  putative lipoprotein  33.86 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3130  hypothetical protein  30.88 
 
 
245 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5055  hypothetical protein  34.83 
 
 
265 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2172  hypothetical protein  33.7 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2125  hypothetical protein  33.7 
 
 
313 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1451  hypothetical protein  35.48 
 
 
268 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0627  SH3 type 3 domain protein  31.09 
 
 
382 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.496053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2466  hypothetical protein  37.1 
 
 
119 aa  46.2  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2832  hypothetical protein  38.67 
 
 
129 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4775  hypothetical protein  35.62 
 
 
329 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453891 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2600  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.370975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3840  hypothetical protein  30.43 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4334  hypothetical protein  33.75 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.966043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>