83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_3584 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  68.26 
 
 
678 aa  942    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  100 
 
 
704 aa  1415    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  53.74 
 
 
689 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  68.82 
 
 
678 aa  949    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  68.68 
 
 
678 aa  948    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  55.48 
 
 
674 aa  736    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  53.46 
 
 
689 aa  699    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  53.74 
 
 
657 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  68.68 
 
 
678 aa  946    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  68.96 
 
 
678 aa  949    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  68.68 
 
 
678 aa  946    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  71.89 
 
 
680 aa  991    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  71.43 
 
 
680 aa  996    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  71.15 
 
 
680 aa  992    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  71.57 
 
 
680 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  72.32 
 
 
680 aa  997    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  68.54 
 
 
678 aa  946    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  69.1 
 
 
678 aa  947    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  53.4 
 
 
672 aa  709    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  53.19 
 
 
672 aa  710    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  69.1 
 
 
678 aa  947    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  50.62 
 
 
680 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  50.21 
 
 
682 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  33.33 
 
 
604 aa  194  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  35.29 
 
 
555 aa  179  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  33.76 
 
 
603 aa  176  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  34.27 
 
 
603 aa  176  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  33.64 
 
 
653 aa  171  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  33.22 
 
 
607 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  31.63 
 
 
604 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  32.62 
 
 
602 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  32.34 
 
 
603 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  31.33 
 
 
604 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  30 
 
 
616 aa  137  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  31.03 
 
 
603 aa  137  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  29.36 
 
 
619 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 
634 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  29.13 
 
 
677 aa  135  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 
634 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 
634 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  28.21 
 
 
634 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  30.15 
 
 
595 aa  134  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  30.6 
 
 
626 aa  134  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  28.53 
 
 
627 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  28.73 
 
 
628 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  27.76 
 
 
624 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  29.85 
 
 
604 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  28.25 
 
 
627 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  27.36 
 
 
634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  28.92 
 
 
634 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  29.54 
 
 
604 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  31.13 
 
 
605 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  31.67 
 
 
607 aa  121  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  27.33 
 
 
629 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  30.3 
 
 
596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  29.79 
 
 
635 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  26.09 
 
 
661 aa  113  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  26.16 
 
 
721 aa  112  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  28.48 
 
 
617 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  29.66 
 
 
605 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  29.36 
 
 
605 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  29.63 
 
 
605 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  25.99 
 
 
631 aa  107  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  29.23 
 
 
625 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  26.77 
 
 
394 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  26.77 
 
 
396 aa  103  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  27.05 
 
 
603 aa  99  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  27.05 
 
 
603 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  25 
 
 
658 aa  87.8  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  23.06 
 
 
666 aa  82.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  28.13 
 
 
628 aa  71.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  24.65 
 
 
510 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  20.67 
 
 
617 aa  68.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  27.04 
 
 
705 aa  67  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  23.49 
 
 
576 aa  65.5  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  24.09 
 
 
573 aa  60.1  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  21.19 
 
 
621 aa  56.6  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0327  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
399 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  22.76 
 
 
576 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0322  extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 
400 aa  47.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.809903  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0190  hypothetical protein  24.06 
 
 
407 aa  47  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.613594  normal  0.386647 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  25.74 
 
 
576 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0148  extracellular ligand-binding receptor  25.47 
 
 
403 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>