26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2901 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2901  phage integrase family protein  100 
 
 
400 aa  826    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1599  integrase family protein  40.93 
 
 
434 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0693815  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0516  integrase family protein  29.1 
 
 
521 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3892  site-specific recombinase, phage integrase family protein  28.09 
 
 
437 aa  162  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  28.47 
 
 
513 aa  160  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1698  integrase family protein  28.64 
 
 
436 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1125  phage integrase family protein  28.17 
 
 
533 aa  136  8e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  23.59 
 
 
517 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  23.59 
 
 
517 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  23.59 
 
 
517 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2950  integrase family protein  26.86 
 
 
451 aa  95.5  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.229456  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3233  integrase family protein  28.62 
 
 
526 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  23.51 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4064  integrase family protein  26.07 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  21.72 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0323  phage integrase  25.26 
 
 
342 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.78 
 
 
298 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.98 
 
 
300 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  37.68 
 
 
278 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1744  integrase family protein  29.57 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.145227  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00070  putative site-specific recombinase  25.91 
 
 
295 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  43.14 
 
 
307 aa  43.9  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.18 
 
 
300 aa  43.9  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  24.19 
 
 
296 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  40 
 
 
297 aa  43.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  20.55 
 
 
698 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>