41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0134 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0134  mannitol repressor protein  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4072  mannitol repressor protein  90.82 
 
 
196 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3903  mannitol repressor protein  90.82 
 
 
196 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.874677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3887  mannitol repressor protein  90.82 
 
 
196 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4010  mannitol repressor protein  90.82 
 
 
196 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.272452 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3965  mannitol repressor protein  90.82 
 
 
196 aa  359  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.723807 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0111  mannitol repressor protein  89.01 
 
 
195 aa  346  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4100  mannitol repressor protein  89.01 
 
 
195 aa  346  1e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4971  mannitol repressor protein  89.01 
 
 
195 aa  346  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3934  mannitol repressor protein  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4018  mannitol repressor protein  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3808  mannitol repressor protein  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.498661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03407  hypothetical protein  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0105  mannitol repressor, MtlR  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03456  DNA-binding repressor  88.48 
 
 
195 aa  345  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4126  mannitol repressor protein  77.01 
 
 
184 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3778  mannitol repressor protein  77.01 
 
 
184 aa  278  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0028  mannitol repressor protein  77.01 
 
 
184 aa  278  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0074  mannitol repressor protein  77.46 
 
 
183 aa  275  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4163  mannitol repressor protein  72.68 
 
 
188 aa  264  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4445  mannitol repressor protein  71.43 
 
 
187 aa  260  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0054  mannitol repressor protein  70.65 
 
 
201 aa  241  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.667154  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0194  mannitol repressor protein  43.68 
 
 
193 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2815  mannitol repressor protein  40.59 
 
 
176 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00832  mannitol repressor protein  41.76 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001634  mannitol operon repressor  41.18 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1250  mannitol repressor protein  36.69 
 
 
171 aa  119  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0984  mannitol repressor protein  37.2 
 
 
179 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0090  mannitol repressor protein  38.41 
 
 
179 aa  115  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.345813  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3250  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.22 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.985054  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3317  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.27 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0781  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.93 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.365395  normal  0.220533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0764  mannitol repressor, MtlR  32.2 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02723  hypothetical protein  32.2 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.260135  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3087  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.93 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02760  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.2 
 
 
169 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.310913  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3264  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.93 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.577406  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001415  putative transcriptional regulator  25.77 
 
 
172 aa  60.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3071  putative DNA-binding transcriptional regulator  32.2 
 
 
169 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0270889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4231  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.09 
 
 
169 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3359  putative DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 
161 aa  58.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>