More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0296 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  100 
 
 		 489 aa  1001    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  56.58 
 
 		 491 aa  549  1e-155  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  44.3 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  44.21 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  44.68 
 
 		 428 aa  350  4e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  44.89 
 
 		 422 aa  345  1e-93  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  43.61 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  43.49 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  42.82 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.93 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  38.25 
 
 		 399 aa  269  8e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39.8 
 
 		 478 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  40.56 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2520  malate dehydrogenase  38.9 
 
 		 439 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.6438  normal  0.0151254 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  37.22 
 
 		 390 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  39.13 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  38.89 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  38.89 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  38.89 
 
 		 412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  39.13 
 
 		 412 aa  259  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  38.87 
 
 		 376 aa  259  9e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  38.02 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  40.2 
 
 		 503 aa  259  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  40.8 
 
 		 390 aa  259  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  38.87 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  39.41 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  39.41 
 
 		 402 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  39.71 
 
 		 481 aa  257  3e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  38.16 
 
 		 412 aa  257  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  38.98 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  39.13 
 
 		 412 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  37.22 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  37.09 
 
 		 399 aa  253  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  36.72 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  36.97 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  36.97 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  36.97 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  36.97 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  36.97 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  34.29 
 
 		 409 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  34.29 
 
 		 409 aa  251  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  39.79 
 
 		 384 aa  250  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  41.43 
 
 		 463 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  38.83 
 
 		 474 aa  247  3e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  36.13 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  39.01 
 
 		 423 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  40.43 
 
 		 391 aa  247  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1243  malic enzyme  34.63 
 
 		 769 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  34.31 
 
 		 409 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0471  malate dehydrogenase  39.05 
 
 		 376 aa  246  9e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122448  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  38.44 
 
 		 474 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  38.54 
 
 		 403 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  37.88 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.87 
 
 		 463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  38.87 
 
 		 463 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1029  malic enzyme  34.62 
 
 		 764 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  36.83 
 
 		 427 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  38.62 
 
 		 493 aa  243  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1765  malate dehydrogenase  37.62 
 
 		 422 aa  243  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188072 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.37 
 
 		 387 aa  242  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0246  malic enzyme  35.49 
 
 		 776 aa  242  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.838857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2224  malic enzyme  35.6 
 
 		 759 aa  241  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0359  malic enzyme  38.95 
 
 		 769 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5085  malic enzyme  37.68 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  36.72 
 
 		 400 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  37.28 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5135  malate dehydrogenase  37.62 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  37.28 
 
 		 414 aa  240  4e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4958  malate dehydrogenase  37.68 
 
 		 425 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  37.47 
 
 		 379 aa  240  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  38.81 
 
 		 780 aa  240  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0248  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))., Phosphate acetyltransferase  36.99 
 
 		 757 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0765  malic enzyme  35.86 
 
 		 754 aa  239  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0423248  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1089  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  34.62 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.864025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0605  malate dehydrogenase  36.57 
 
 		 432 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  37.19 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.38 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1181  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  37.87 
 
 		 407 aa  237  3e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.682701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03522  NADP-dependent malic enzyme  34.21 
 
 		 411 aa  237  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1367  malic enzyme  34.73 
 
 		 779 aa  237  4e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0380  malate dehydrogenase  37.44 
 
 		 425 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0403  malic enzyme, NAD-binding  36.07 
 
 		 450 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  35 
 
 		 414 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2869  malic enzyme  33.73 
 
 		 761 aa  236  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000177126 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0997  malic enzyme  34.27 
 
 		 777 aa  236  7e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.158987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  38.05 
 
 		 474 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  39.32 
 
 		 407 aa  236  9e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1269  malic enzyme  35.16 
 
 		 779 aa  236  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.525931  normal  0.614845 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  38.54 
 
 		 469 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1573  malic enzyme  35.36 
 
 		 759 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4118  malate oxidoreductase, putative  37.95 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0401  malate dehydrogenase  36.88 
 
 		 422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1209  oxaloacetate-decarboxylating malate dehydrogenase (NADP(+)) phosphate acetyltransferase  36.97 
 
 		 761 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000448619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  39.47 
 
 		 402 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  37.77 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2289  malic enzyme  33.04 
 
 		 757 aa  234  3e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.999733  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  35.48 
 
 		 754 aa  234  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>