More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0031 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0031  malate dehydrogenase  100 
 
 		 428 aa  870    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.399579  normal  0.119769 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0373  malate dehydrogenase  62.2 
 
 		 448 aa  545  1e-154  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0671  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.92 
 
 		 432 aa  530  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.13637  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1691  malate dehydrogenase  62.47 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.145089  normal  0.0768004 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2233  malate dehydrogenase  61.59 
 
 		 434 aa  511  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.70342  normal  0.683923 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1054  malate dehydrogenase  58.27 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.767504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0564  malate dehydrogenase  61.41 
 
 		 434 aa  505  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0985  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.33 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000205214  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2446  malate dehydrogenase  44.92 
 
 		 491 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.42 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.78 
 
 		 407 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  51.4 
 
 		 403 aa  365  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  52.43 
 
 		 481 aa  368  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.95 
 
 		 387 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  49.35 
 
 		 399 aa  355  1e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.95 
 
 		 384 aa  354  1e-96  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  49.1 
 
 		 399 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  49.1 
 
 		 399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  44.88 
 
 		 409 aa  353  5e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  48.84 
 
 		 399 aa  352  7e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  48.51 
 
 		 414 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  48.84 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  48.84 
 
 		 399 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  48.51 
 
 		 414 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  48.84 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  48.84 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  46.06 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  47.79 
 
 		 412 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  43.66 
 
 		 409 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  43.66 
 
 		 409 aa  348  8e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  47.79 
 
 		 412 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.37 
 
 		 474 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.25 
 
 		 407 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  47.55 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  47.55 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  47.55 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.48 
 
 		 478 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  47.3 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  47.55 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  47.55 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  47.79 
 
 		 412 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  47.88 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  47.88 
 
 		 402 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  47.52 
 
 		 414 aa  343  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  48.05 
 
 		 403 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  51.08 
 
 		 391 aa  342  8e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  48.19 
 
 		 390 aa  342  1e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.82 
 
 		 411 aa  341  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.44 
 
 		 478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  45.73 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  47.18 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.65 
 
 		 414 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  48.58 
 
 		 400 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  45.57 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  49.61 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  47.87 
 
 		 394 aa  335  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  47.89 
 
 		 423 aa  333  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.17 
 
 		 489 aa  333  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  46.02 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.42 
 
 		 399 aa  329  6e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  43.16 
 
 		 780 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  48.62 
 
 		 417 aa  328  9e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1455  malic enzyme  42.69 
 
 		 779 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.163734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.75 
 
 		 407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0296  malate dehydrogenase  44.68 
 
 		 489 aa  327  3e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.491674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0502  malic enzyme  44.26 
 
 		 773 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214908  normal  0.395596 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  46.26 
 
 		 379 aa  323  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  45.34 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  45.34 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1700  malic enzyme  44.16 
 
 		 752 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3930  malic enzyme  44.03 
 
 		 771 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.77 
 
 		 463 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.92 
 
 		 468 aa  322  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.73 
 
 		 402 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  46.07 
 
 		 376 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.75 
 
 		 467 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  47.49 
 
 		 474 aa  320  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  46.07 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.5 
 
 		 405 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4039  malic enzyme  43.09 
 
 		 771 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.601427  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  43.37 
 
 		 760 aa  319  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  47.86 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3110  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  46.92 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  44.58 
 
 		 752 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3788  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2586  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0220  malic enzyme  43.97 
 
 		 756 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.667581  hitchhiker  0.000000000555006 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0118  malic enzyme  44.97 
 
 		 763 aa  317  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0019  malic enzyme  43.72 
 
 		 773 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3524  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.753922  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0112  NADP-dependent malic enzyme (NADP-me)  42.07 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3849  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.416227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3123  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3533  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.78558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1969  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.725411  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0245  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000009441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0237  malic enzyme  43.72 
 
 		 756 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0318  malic enzyme  43.47 
 
 		 756 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>