More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0967 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  100 
 
 
407 aa  806    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  62.11 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  62.11 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.67 
 
 
387 aa  462  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  61.34 
 
 
414 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  61.42 
 
 
403 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  56.09 
 
 
409 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  56.09 
 
 
409 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  59.06 
 
 
412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  58.06 
 
 
412 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  56.52 
 
 
399 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  56.12 
 
 
399 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  56.12 
 
 
399 aa  442  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  56.12 
 
 
399 aa  443  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  57.57 
 
 
412 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  56.12 
 
 
399 aa  443  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  56.12 
 
 
399 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  58.06 
 
 
412 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  57.52 
 
 
383 aa  444  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  56.12 
 
 
399 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  57.57 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  56.27 
 
 
399 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  57.57 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  57.57 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  56.31 
 
 
427 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  57.57 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  57.57 
 
 
412 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  54.25 
 
 
409 aa  437  1e-121  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  58.48 
 
 
402 aa  436  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  54.08 
 
 
399 aa  436  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  58.48 
 
 
402 aa  436  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  59.39 
 
 
403 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.59 
 
 
390 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  57.84 
 
 
481 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  59.2 
 
 
478 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.54 
 
 
478 aa  431  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  56.38 
 
 
400 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  56.97 
 
 
411 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  56.67 
 
 
407 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  57.43 
 
 
407 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  58.82 
 
 
390 aa  424  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  58.38 
 
 
391 aa  419  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  55.91 
 
 
387 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.13 
 
 
503 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.22 
 
 
405 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  56.52 
 
 
390 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.35 
 
 
467 aa  411  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.15 
 
 
384 aa  408  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.47 
 
 
489 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.33 
 
 
463 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.33 
 
 
463 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.12 
 
 
414 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.07 
 
 
402 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  56.38 
 
 
401 aa  409  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  54.03 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.77 
 
 
392 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.33 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  57.99 
 
 
463 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  57.57 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  53.79 
 
 
394 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  58.11 
 
 
463 aa  398  1e-109  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.05 
 
 
463 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.22 
 
 
500 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.57 
 
 
468 aa  398  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  56.62 
 
 
466 aa  395  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  53.52 
 
 
474 aa  391  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  52.19 
 
 
473 aa  388  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.22 
 
 
481 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  54.59 
 
 
493 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  55.34 
 
 
376 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  55.34 
 
 
376 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  54.35 
 
 
457 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2878  malic enzyme  50 
 
 
751 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1217  malic enzyme  49.75 
 
 
759 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  56.66 
 
 
479 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.75 
 
 
492 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  52.75 
 
 
474 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  51.91 
 
 
407 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3467  malic enzyme  50.12 
 
 
752 aa  383  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  54.55 
 
 
402 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1271  malate dehydrogenase  53.62 
 
 
386 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000347822  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0848  malic enzyme  50.12 
 
 
760 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.29 
 
 
460 aa  380  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  55.49 
 
 
470 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1637  malic enzyme  49.42 
 
 
752 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000270094  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0210  malic enzyme  49.38 
 
 
754 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1089  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.55 
 
 
409 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.864025  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3085  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.31 
 
 
418 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000232423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.78 
 
 
399 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  54.62 
 
 
461 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0500  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+)), Phosphate acetyltransferase  48.36 
 
 
751 aa  376  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  55.07 
 
 
469 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  53.78 
 
 
485 aa  376  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2970  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.98 
 
 
412 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.017346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  55.53 
 
 
477 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2798  malic enzyme  49.53 
 
 
780 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.272512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.72 
 
 
470 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0896  malate dehydrogenase  51.89 
 
 
381 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1888  malic enzyme  50.49 
 
 
749 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2321  malic enzyme  50.61 
 
 
749 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>