More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0212 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  100 
 
 		 500 aa  986    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  70.95 
 
 		 457 aa  621  1e-176  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.05 
 
 		 467 aa  581  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  64.22 
 
 		 468 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.54 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  63.4 
 
 		 470 aa  554  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.44 
 
 		 460 aa  551  1e-155  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  63.12 
 
 		 466 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  61.57 
 
 		 493 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  64.24 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  64.11 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  63 
 
 		 473 aa  538  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  63.78 
 
 		 490 aa  541  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  60.3 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  63.44 
 
 		 461 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  63.53 
 
 		 479 aa  538  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.58 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  63.3 
 
 		 481 aa  533  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  63.78 
 
 		 484 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  60.68 
 
 		 485 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.11 
 
 		 466 aa  525  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65 
 
 		 470 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  59.64 
 
 		 481 aa  524  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  60.69 
 
 		 470 aa  521  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.02 
 
 		 478 aa  521  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.46 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  60.44 
 
 		 462 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.57 
 
 		 489 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.54 
 
 		 492 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  55.71 
 
 		 473 aa  477  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.8 
 
 		 463 aa  474  1e-132  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  54.57 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.77 
 
 		 474 aa  468  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.83 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.83 
 
 		 463 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.85 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  54.21 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.61 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  50.72 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.29 
 
 		 463 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  53.32 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.53 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  60.85 
 
 		 394 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  50.44 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  56.28 
 
 		 399 aa  432  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  56.54 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  56.54 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  56.02 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  52.39 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.91 
 
 		 390 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.74 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  55.76 
 
 		 400 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  54.52 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.52 
 
 		 407 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  57.68 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.11 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  55.86 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  58.61 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  58.24 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  59.52 
 
 		 428 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.9 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  55.03 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  55.03 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  59.62 
 
 		 396 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  56.22 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.66 
 
 		 384 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  55.01 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.99 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  54.75 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.69 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  61.26 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.62 
 
 		 405 aa  388  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  55.56 
 
 		 391 aa  388  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  58.52 
 
 		 403 aa  386  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.81 
 
 		 411 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  54.06 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  51.62 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4075  malate dehydrogenase  59.34 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0926309 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.52 
 
 		 392 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.63 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  52.16 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  53.05 
 
 		 412 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  55.81 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  58.33 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  52.16 
 
 		 409 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.32 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  52.53 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  52.53 
 
 		 412 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  52.28 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  52.28 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  52.28 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  52.28 
 
 		 402 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  52.28 
 
 		 402 aa  372  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  52.28 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  52.28 
 
 		 412 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.13 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>