More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3355 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  71.13 
 
 
473 aa  645    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  72.73 
 
 
474 aa  637    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  100 
 
 
492 aa  981    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  58.13 
 
 
481 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.6 
 
 
478 aa  528  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.25 
 
 
478 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.88 
 
 
489 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.54 
 
 
500 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  55.9 
 
 
457 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.29 
 
 
467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.08 
 
 
460 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.9 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  56.52 
 
 
490 aa  466  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.2 
 
 
468 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.57 
 
 
476 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.93 
 
 
463 aa  465  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  53.04 
 
 
463 aa  461  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.53 
 
 
503 aa  462  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  55.84 
 
 
513 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  53.78 
 
 
470 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  53.65 
 
 
462 aa  458  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.16 
 
 
463 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.16 
 
 
463 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.09 
 
 
463 aa  456  1e-127  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.68 
 
 
470 aa  451  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  54.82 
 
 
461 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  53.54 
 
 
493 aa  451  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  53.83 
 
 
466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.13 
 
 
463 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.44 
 
 
481 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  51.34 
 
 
474 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.14 
 
 
484 aa  440  9.999999999999999e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.95 
 
 
466 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  52.75 
 
 
479 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  52.86 
 
 
485 aa  434  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  53.86 
 
 
477 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  57.55 
 
 
394 aa  425  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  55.33 
 
 
399 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.57 
 
 
470 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.05 
 
 
390 aa  422  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.99 
 
 
470 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  55.33 
 
 
399 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  55.58 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  55.58 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  55.58 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  50.23 
 
 
473 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  55.58 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  55.58 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  55.53 
 
 
399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  49.24 
 
 
504 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  56.79 
 
 
387 aa  413  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.97 
 
 
461 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  54.94 
 
 
400 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.4 
 
 
407 aa  413  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.63 
 
 
462 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.81 
 
 
399 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.67 
 
 
386 aa  410  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  52.51 
 
 
383 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  46.64 
 
 
474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  56.2 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.85 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  55.5 
 
 
427 aa  402  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  54.71 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  54.71 
 
 
402 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  47.2 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  54.71 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  49.87 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  54.45 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  54.71 
 
 
412 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  54.45 
 
 
412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.6 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  49.87 
 
 
409 aa  400  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  53.85 
 
 
414 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  53.85 
 
 
414 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.96 
 
 
384 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.9 
 
 
387 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.19 
 
 
399 aa  394  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  57.66 
 
 
396 aa  394  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  54.27 
 
 
464 aa  392  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  53.85 
 
 
414 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.75 
 
 
416 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  50.67 
 
 
409 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.09 
 
 
395 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.89 
 
 
405 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  57.6 
 
 
403 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  55.09 
 
 
428 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  54.38 
 
 
403 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  53.42 
 
 
407 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.49 
 
 
402 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  54.13 
 
 
390 aa  378  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.27 
 
 
405 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.35 
 
 
414 aa  374  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.53 
 
 
390 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  58.29 
 
 
391 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  51.75 
 
 
376 aa  363  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>