More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1297 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  942    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  65.8 
 
 		 463 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  67.28 
 
 		 463 aa  599  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  63.76 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  63.76 
 
 		 463 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  65.87 
 
 		 463 aa  593  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  64.92 
 
 		 462 aa  578  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0554  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  66.45 
 
 		 463 aa  565  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  54.53 
 
 		 481 aa  504  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.54 
 
 		 478 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.11 
 
 		 478 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  55.26 
 
 		 461 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.19 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  51.33 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.66 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.36 
 
 		 503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  52.29 
 
 		 470 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.39 
 
 		 500 aa  445  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  52.27 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.06 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.65 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.43 
 
 		 489 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  52.56 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  49.13 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  52.35 
 
 		 513 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  49.54 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.93 
 
 		 481 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  52.13 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  52.15 
 
 		 479 aa  434  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3884  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.35 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  50.66 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  51.5 
 
 		 477 aa  430  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  49.14 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2955  malate dehydrogenase  50.11 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000459536  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  56.54 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.02 
 
 		 484 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.49 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.67 
 
 		 474 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.32 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  53.59 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  54.29 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  53.77 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  56.95 
 
 		 387 aa  421  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  53.47 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  53.47 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  53.47 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  53.47 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  53.47 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  49.89 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3529  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.84 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.85 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  52.59 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  54.28 
 
 		 383 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.32 
 
 		 492 aa  415  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.33 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  58.4 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  51.3 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  56.85 
 
 		 412 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.37 
 
 		 384 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  51.3 
 
 		 409 aa  406  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  53.25 
 
 		 400 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.82 
 
 		 399 aa  403  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  56.59 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  56.59 
 
 		 412 aa  404  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.09 
 
 		 399 aa  404  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.01 
 
 		 407 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  54.24 
 
 		 390 aa  405  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  56.33 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  56.33 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  56.33 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  56.33 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  57.07 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  55.41 
 
 		 403 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  57.07 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  56.33 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  57.7 
 
 		 396 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  55.81 
 
 		 412 aa  397  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  52.14 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.15 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  52.14 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  52.85 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  56.5 
 
 		 403 aa  393  1e-108  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  54.29 
 
 		 401 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.75 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.54 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.2 
 
 		 392 aa  388  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.06 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  54.57 
 
 		 411 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  55.35 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  51.91 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  56.2 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  54.81 
 
 		 391 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1647  malate dehydrogenase  47.14 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  54.12 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0547  malic enzyme NAD binding subunit  52.25 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.199377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  58.84 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  53.51 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  53.55 
 
 		 407 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  59.28 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>