More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0896 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0896  malate dehydrogenase  100 
 
 
381 aa  775    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.662233  normal  0.714122 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1316  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  88.45 
 
 
381 aa  676    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.034067  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1089  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  74.73 
 
 
409 aa  570  1e-161  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.864025  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1271  malate dehydrogenase  74.02 
 
 
386 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000347822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  52.91 
 
 
399 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  53.17 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  53.17 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  53.17 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  53.17 
 
 
399 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  53.17 
 
 
399 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  52.65 
 
 
399 aa  409  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  52.91 
 
 
399 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  52.25 
 
 
399 aa  411  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  53.95 
 
 
414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  53.95 
 
 
414 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.96 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  50.39 
 
 
409 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  50.39 
 
 
409 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  53.97 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  53.41 
 
 
414 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  54.89 
 
 
391 aa  395  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  54.32 
 
 
390 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.89 
 
 
407 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  53.7 
 
 
401 aa  391  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  52.28 
 
 
403 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.89 
 
 
411 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  49.09 
 
 
409 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0140  NAD-dependent malic enzyme  52.82 
 
 
390 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174768  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1912  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.46 
 
 
402 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.07 
 
 
384 aa  381  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  50.54 
 
 
383 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  49.73 
 
 
427 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  51.61 
 
 
394 aa  374  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0147  malate dehydrogenase  53.23 
 
 
402 aa  373  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  51.45 
 
 
412 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10070  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.14 
 
 
407 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000523345  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.27 
 
 
489 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  366  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  50.66 
 
 
412 aa  365  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  48.92 
 
 
387 aa  368  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4497  malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4332  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  50.66 
 
 
412 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  52.46 
 
 
407 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4729  putative malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3287  malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.28 
 
 
392 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4718  putative malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  50.66 
 
 
412 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  51.99 
 
 
403 aa  365  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.86 
 
 
468 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  50.14 
 
 
387 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  50.14 
 
 
481 aa  362  4e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  51.07 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  52.63 
 
 
428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  51.07 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.1 
 
 
397 aa  358  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.14 
 
 
399 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.03 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  48.27 
 
 
474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  54.01 
 
 
470 aa  354  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2371  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.91 
 
 
405 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3355  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  51.4 
 
 
492 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240183 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  47.91 
 
 
478 aa  353  4e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  48.31 
 
 
479 aa  352  8.999999999999999e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.91 
 
 
467 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.59 
 
 
481 aa  350  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0949  malate dehydrogenase  46.52 
 
 
379 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  49.86 
 
 
395 aa  350  2e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  50.42 
 
 
464 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.01 
 
 
414 aa  350  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.7 
 
 
386 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  51.6 
 
 
407 aa  348  6e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0379  malate dehydrogenase  46.93 
 
 
376 aa  348  6e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  51.54 
 
 
513 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3085  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  49.05 
 
 
418 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000232423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  51.23 
 
 
490 aa  347  2e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0395  malate dehydrogenase  46.9 
 
 
376 aa  345  5e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.3 
 
 
476 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.85 
 
 
500 aa  345  6e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05030  malic enzyme  50.95 
 
 
390 aa  345  6e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  49.01 
 
 
461 aa  345  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10480  malic enzyme  49.58 
 
 
493 aa  345  7e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.549836  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.65 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.65 
 
 
463 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  47.15 
 
 
473 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  48.09 
 
 
457 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.3 
 
 
460 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.65 
 
 
463 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  50.58 
 
 
484 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  47.58 
 
 
466 aa  340  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  47.81 
 
 
474 aa  340  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  48.48 
 
 
463 aa  339  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  49.59 
 
 
477 aa  339  5e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  48.9 
 
 
463 aa  338  9e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  52.41 
 
 
391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  48.9 
 
 
470 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  49.02 
 
 
474 aa  335  7.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  51.09 
 
 
473 aa  335  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  46.98 
 
 
469 aa  333  3e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1534  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.92 
 
 
423 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>