More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1944 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  64.72 
 
 		 583 aa  744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  74.09 
 
 		 575 aa  897    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 575 aa  1186    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0529  arginyl-tRNA synthetase  49.6 
 
 		 614 aa  573  1.0000000000000001e-162  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000661895 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  43.67 
 
 		 556 aa  482  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 559 aa  476  1e-133  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 561 aa  477  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 556 aa  475  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 560 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 553 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 556 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 556 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 553 aa  458  1e-127  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 564 aa  457  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 559 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 554 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  44.52 
 
 		 554 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  42.78 
 
 		 561 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 554 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1742  arginyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 522 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 550 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 553 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 586 aa  438  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  432  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 		 556 aa  434  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 564 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  43.99 
 
 		 551 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_002936  DET1270  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  432  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0106385  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 546 aa  429  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1081  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 556 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2036  arginyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 		 561 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.432071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 561 aa  431  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 586 aa  426  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 551 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1197  arginyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 556 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 546 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0628  arginyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 562 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0559225  decreased coverage  0.00224273 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 568 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 592 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 561 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  40.23 
 
 		 584 aa  421  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 598 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0704  arginyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 575 aa  419  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281403 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2782  arginyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 557 aa  415  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.535695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 562 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 560 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  41.57 
 
 		 551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1250  arginyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409478  normal  0.0986355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 589 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0294  arginyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 609 aa  402  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 587 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 589 aa  400  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3866  arginyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 587 aa  400  9.999999999999999e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.42649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 		 579 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 559 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18400  arginyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 547 aa  402  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.25654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 554 aa  398  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0280  arginyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0920432  normal  0.27324 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 592 aa  395  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1004  arginyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 570 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2239  arginyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 609 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.183357 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0188  arginyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 594 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 586 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 554 aa  399  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 550 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2431  arginyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 598 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2343  arginyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 598 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 550 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1372  arginyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 529 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1946  arginyl-tRNA synthetase  37.56 
 
 		 609 aa  392  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1793  arginyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 556 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 561 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 		 543 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 587 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2288  arginyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.770548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>