52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1153 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1153  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  629  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.419264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15340  hypothetical protein  45.85 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00498288  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09120  hypothetical protein  43.27 
 
 		 288 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.039134  normal  0.507891 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1283  hypothetical protein  30.26 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3694  hypothetical protein  31.87 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000281163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1725  hypothetical protein  27.74 
 
 		 246 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.290957  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0227  hypothetical protein  27.96 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0221603 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0406  hypothetical protein  27.86 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000345216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05000  hypothetical protein  26.81 
 
 		 247 aa  116  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1788  hypothetical protein  28.28 
 
 		 283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0924  hypothetical protein  25.64 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000208193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0349  hypothetical protein  28.52 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0175  hypothetical protein  26.18 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12073  hypothetical protein  26.55 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.793461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0125  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.212307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0825  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.246214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0495  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0109  hypothetical protein  26.2 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3328  hypothetical protein  26.77 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1203  hypothetical protein  26.76 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0634007  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0193  hypothetical protein  26.86 
 
 		 254 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.125888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4057  hypothetical protein  25.35 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303287  normal  0.100752 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2638  hypothetical protein  26.84 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1925  hypothetical protein  23.33 
 
 		 247 aa  95.9  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000101879  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0819  hypothetical protein  26.95 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0307  hypothetical protein  27.31 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00166335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0247  hypothetical protein  27.11 
 
 		 245 aa  93.2  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3381  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1941  hypothetical protein  23.79 
 
 		 245 aa  90.1  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1156  hypothetical protein  21.93 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00259628  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1574  hypothetical protein  26.01 
 
 		 243 aa  89.4  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.235468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0321  hypothetical protein  25.18 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.322219 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0664  hypothetical protein  24.46 
 
 		 247 aa  82  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0392  hypothetical protein  22.51 
 
 		 232 aa  62.4  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0101615  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7466  hypothetical protein  28.67 
 
 		 492 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2263  Uracil-DNA glycosylase superfamily  24.18 
 
 		 485 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2983  putative Uracil-DNA glycosylase  25.71 
 
 		 496 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4607  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  27.34 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03048  uracil DNA glycosylase superfamily protein  25.16 
 
 		 477 aa  47  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2339  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.17 
 
 		 491 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716146 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2581  Uracil-DNA glycosylase superfamily  26 
 
 		 485 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148154  normal  0.520534 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2306  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.38 
 
 		 485 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0113153 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2232  putative uracil-DNA glycosylase  27.39 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3539  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  26.39 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0908  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  27.39 
 
 		 485 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2002  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  23.85 
 
 		 495 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.515023  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2261  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  26.53 
 
 		 485 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.102912  normal  0.247283 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01932  putative DNA polymerase related protein  23.44 
 
 		 265 aa  43.1  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1899  phage SPO1 DNA polymerase-related protein  22.67 
 
 		 480 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.530135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2068  uracil-DNA glycosylase superfamily protein  24.46 
 
 		 465 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.803704  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1758  uracil-DNA glycosylase  23.02 
 
 		 299 aa  42.4  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2122  hypothetical protein  25.69 
 
 		 278 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0384708  normal  0.383593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>