More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2262 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  100 
 
 		 386 aa  800    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2039  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.294118  normal  0.96458 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  28.67 
 
 		 348 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0522  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  32.47 
 
 		 729 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0757  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.122576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0701  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000226644  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09810  glycosyl transferase  28.85 
 
 		 405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  32.74 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  34.73 
 
 		 329 aa  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  27.62 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 		 369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0434  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  28.76 
 
 		 731 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  28.96 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0263  glycosyl transferase family protein  31.42 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1307  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 		 335 aa  105  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3933  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.27 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3690  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.65 
 
 		 329 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0585  glycosyl transferase  30.22 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  29.13 
 
 		 970 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  27.75 
 
 		 333 aa  102  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  33.03 
 
 		 324 aa  102  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  41.59 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2038  glycosyl transferase family 2  29.32 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.723912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 		 327 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.69 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  30.1 
 
 		 301 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  26.27 
 
 		 326 aa  98.6  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1227  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.06 
 
 		 270 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000982569  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.26 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.26 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.26 
 
 		 327 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  26.99 
 
 		 275 aa  98.6  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1282  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  28.05 
 
 		 269 aa  97.1  5e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1296  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 		 343 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  45.45 
 
 		 256 aa  96.7  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2370  glycosyltransferase  33.51 
 
 		 319 aa  96.7  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2173  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  32.08 
 
 		 662 aa  95.9  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30100  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.25 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  26.05 
 
 		 325 aa  95.5  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  33.01 
 
 		 672 aa  95.1  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  41.94 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0249  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 573 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  27.86 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0243  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 		 573 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  26.97 
 
 		 344 aa  94  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1918  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 		 290 aa  94  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  hitchhiker  0.00463208 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0582  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  27.23 
 
 		 272 aa  93.6  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 		 344 aa  93.6  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  41.28 
 
 		 274 aa  92.8  9e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  27.12 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26 
 
 		 323 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1241  glycosyltransferase  24.89 
 
 		 306 aa  92.8  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000261425  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  26.59 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1278  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  36.63 
 
 		 295 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0908017  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 		 321 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 		 344 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1212  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  31.33 
 
 		 946 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.333736  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  27.14 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  26.59 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.41 
 
 		 941 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 		 347 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 324 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  34.4 
 
 		 326 aa  90.5  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0784  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 325 aa  90.5  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.33296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  40.16 
 
 		 289 aa  90.5  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  26.59 
 
 		 344 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  45.56 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  26.79 
 
 		 344 aa  90.1  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  41.94 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2965  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 309 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0614913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  32.76 
 
 		 351 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2037  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.537056 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  39.78 
 
 		 181 aa  89  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  41 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1412  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 		 255 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  47.78 
 
 		 340 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  44.44 
 
 		 386 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  28.09 
 
 		 328 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0738  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 319 aa  87.4  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0554497  hitchhiker  0.00271528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  40.71 
 
 		 324 aa  87.4  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  47.47 
 
 		 318 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1987  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  38.39 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 337 aa  86.7  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  32.41 
 
 		 260 aa  86.3  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0992  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  30.3 
 
 		 637 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2807  putative glycosyl transferase  28.88 
 
 		 332 aa  86.3  9e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0445722 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  32.92 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0943  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.799144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 		 354 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  45.63 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4959  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0171285 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>