32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3565 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3565  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  486  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0603  hypothetical protein  98.32 
 
 
238 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3280  hypothetical protein  98.32 
 
 
238 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0792859  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3389  putative CFA/I fimbrial subunit A  83.19 
 
 
238 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0345  putative fimbrial protein  37.44 
 
 
236 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0338  putative fimbrial protein  37.44 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.610599 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0217  putative fimbrial protein  36.45 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0419123 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6643  putative fimbrial protein  31.75 
 
 
273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000724816 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0037  hypothetical protein  31.63 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3246  putative fimbrial protein  29.67 
 
 
235 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106469  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1503  hypothetical protein  26.42 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3327  hypothetical protein  26.19 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2872  hypothetical protein  24.62 
 
 
232 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220895  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0294  hypothetical protein  22.16 
 
 
239 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3972  hypothetical protein  28.06 
 
 
257 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127739  normal  0.222302 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0302  hypothetical protein  26.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.481314  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3312  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00254  hypothetical protein  26.19 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.467905  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00251  hypothetical protein  26.19 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.391336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1506  hypothetical protein  23.49 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5211  hypothetical protein  24.49 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0318  hypothetical protein  30.71 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000777103  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3064  hypothetical protein  21.82 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0504389  normal  0.0240851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0315  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0440166  hitchhiker  0.00820963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0338  hypothetical protein  30.71 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232796  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3330  hypothetical protein  23.49 
 
 
218 aa  42.7  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00251  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00248  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0299  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5207  hypothetical protein  24.16 
 
 
225 aa  42.4  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3315  conserved hypothetical protein  23.49 
 
 
218 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0335  hypothetical protein  23.49 
 
 
236 aa  42  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218104  normal  0.937814 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>