17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1039 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  624  1e-178  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2111  prophage tail fibre domain-containing protein  53.78 
 
 		 1007 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0810598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1577  Tail Collar domain protein  56.08 
 
 		 682 aa  172  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2427  side tail fiber protein  66.97 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  72.6 
 
 		 570 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  44.79 
 
 		 697 aa  112  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2736  Tail Collar domain protein  50.91 
 
 		 689 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0873  side tail fiber protein  46.51 
 
 		 441 aa  86.7  4e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1284  phage tail domain-containing protein  43.48 
 
 		 1137 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2274  Prophage tail fibre domain protein  43.68 
 
 		 1120 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.817873  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  47.06 
 
 		 554 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1042  putative phage tail fiber protein  44.78 
 
 		 469 aa  69.3  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  37.5 
 
 		 588 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  35.82 
 
 		 561 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3474  phage tail fiber repeat  35.94 
 
 		 670 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858569  hitchhiker  0.000000311784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2783  phage tail fiber repeat-containing protein  35.94 
 
 		 670 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.572485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2473  hypothetical protein  35.94 
 
 		 413 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571413 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>