37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1305 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  86.24 
 
 		 200 aa  186  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  85.32 
 
 		 200 aa  185  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  83.49 
 
 		 200 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  83.49 
 
 		 200 aa  181  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  93.68 
 
 		 200 aa  181  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  89.32 
 
 		 197 aa  181  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  68.92 
 
 		 137 aa  103  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  38.32 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  41.25 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  33.67 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  34.38 
 
 		 193 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  34.74 
 
 		 194 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0834  tail fiber assembly protein  33.68 
 
 		 194 aa  52  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  33.68 
 
 		 247 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0097  putative tail fiber assembly protein  34.74 
 
 		 202 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000164491  hitchhiker  2.58934e-46 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2098  tail assembly chaperone gp38  31.13 
 
 		 204 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  32.99 
 
 		 194 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  32.99 
 
 		 194 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2112  tail assembly chaperone gp38  34.02 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.012456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1755  tail fiber assembly protein  34.02 
 
 		 191 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259301  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2099  tail assembly chaperone gp38  31.96 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220604  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2273  tail assembly chaperone gp38  31.96 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.724349  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3817  tail assembly chaperone gp38  26.42 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  34.72 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4026  tail assembly chaperone gp38  31.87 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  36.11 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2737  tail assembly chaperone gp38  32.99 
 
 		 205 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4382  phage tail assembly protein  28.97 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0725445  hitchhiker  0.000673602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  29.06 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  36.92 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1536  tail assembly chaperone gp38  31.18 
 
 		 209 aa  40.8  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1428  phage tail assembly protein  28.97 
 
 		 189 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.220507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>