53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5589 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03953  predicted multidrug efflux system component  99.12 
 
 		 683 aa  1389    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03913  hypothetical protein  99.12 
 
 		 683 aa  1389    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5589  multidrug efflux system protein MdtO  100 
 
 		 683 aa  1398    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4545  multidrug efflux system protein MdtO  98.39 
 
 		 683 aa  1382    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3946  multidrug efflux system protein MdtO  99.12 
 
 		 683 aa  1388    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4638  multidrug efflux system protein MdtO  98.68 
 
 		 683 aa  1385    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4326  multidrug efflux system protein MdtO  98.68 
 
 		 683 aa  1385    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3911  Fusaric acid resistance protein conserved region  98.83 
 
 		 683 aa  1387    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6555  multidrug efflux system protein MdtO  35.5 
 
 		 708 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  28.14 
 
 		 633 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  28.14 
 
 		 633 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0194  fusaric acid resistance protein region  38.62 
 
 		 660 aa  148  4.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.140662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4353  fusaric acid resistance protein region  26.1 
 
 		 665 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3974  fusaric acid resistance protein region  27.04 
 
 		 720 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4511  fusaric acid resistance protein  23.54 
 
 		 663 aa  143  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0314221 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4578  fusaric acid resistance protein region  35.58 
 
 		 699 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108784  hitchhiker  0.00000435415 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4113  fusaric acid resistance protein region  37.57 
 
 		 679 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.981168  normal  0.0322615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2192  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.36 
 
 		 671 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3646  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0600324  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5579  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.152208  hitchhiker  0.00845324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4721  fusaric acid resistance protein region  37.5 
 
 		 688 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00201941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1055  membrane protein-like  38.95 
 
 		 773 aa  133  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00532774  normal  0.601759 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2120  membrane protein, putative efflux pump  32.3 
 
 		 680 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0240  putative multidrug resistance protein MdtO  40.12 
 
 		 600 aa  124  5e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  29.41 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  29.41 
 
 		 725 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  28.57 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  27.82 
 
 		 725 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  24.31 
 
 		 729 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.79 
 
 		 746 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  23.45 
 
 		 728 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  28.43 
 
 		 664 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1148  hypothetical protein  21.9 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1031  hypothetical membrane protein  21.9 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000967259  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1136  hypothetical membrane protein  21.9 
 
 		 717 aa  46.6  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61616  normal  0.960871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1182  hypothetical protein  21.9 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1114  hypothetical protein  21.9 
 
 		 717 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.109888  hitchhiker  0.00000043653 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1472  hypothetical protein  21.43 
 
 		 720 aa  45.8  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000385386  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00964  predicted inner membrane protein  21.13 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000463684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2683  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00493648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1123  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00725319  normal  0.391034 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2356  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0100238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00971  hypothetical protein  21.13 
 
 		 717 aa  45.4  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000599042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1069  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000419542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1074  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166924  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2160  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328985  normal  0.533884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2636  hypothetical protein  21.13 
 
 		 720 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0533993  hitchhiker  0.000000852874 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  21.68 
 
 		 733 aa  44.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2627  hypothetical protein  21.88 
 
 		 712 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0163181  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2538  inner membrane protein YccS  21.88 
 
 		 712 aa  44.7  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05920  hypothetical protein  23.11 
 
 		 733 aa  44.3  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.435767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0555  hypothetical protein  23.11 
 
 		 733 aa  44.3  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1757  hypothetical protein  20.48 
 
 		 711 aa  43.9  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00297692  hitchhiker  0.0000536927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>