25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1900 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1900  hypothetical protein  100 
 
 
527 aa  1085    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000762932 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2360  hypothetical protein  96.06 
 
 
631 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000648065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1377  hypothetical protein  96.06 
 
 
631 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.469999  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1865  hypothetical protein  96.42 
 
 
631 aa  545  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000596823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1492  hypothetical protein  96.42 
 
 
631 aa  545  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2381  conserved hypothetical protein  95.34 
 
 
631 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0833441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01254  hypothetical protein  85.59 
 
 
438 aa  377  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2702  hypothetical protein  38.37 
 
 
686 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.728623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3740  hypothetical protein  39.84 
 
 
685 aa  180  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1381  hypothetical protein  36.69 
 
 
661 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1493  hypothetical protein  37.1 
 
 
679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0707557  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0399  hypothetical protein  34.52 
 
 
438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.719971  normal  0.0793773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0577  hypothetical protein  30.34 
 
 
644 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.464541  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0145  hypothetical protein  29.67 
 
 
633 aa  103  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0534  hypothetical protein  29.06 
 
 
644 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24043 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0465  putative transmembrane signal peptide protein  28.97 
 
 
644 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.559326  normal  0.552522 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0514  membrane-like protein  28.2 
 
 
639 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2636  putative transmembrane signal peptide protein  28.75 
 
 
626 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4521  membrane-like protein  28.57 
 
 
656 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180216  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0576  putative transmembrane signal peptide protein  30.26 
 
 
652 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0277  hypothetical protein  26.97 
 
 
586 aa  57.4  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2301  hypothetical protein  27.17 
 
 
676 aa  55.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179124  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2422  hypothetical protein  24.24 
 
 
606 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651701  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2428  hypothetical protein  24.24 
 
 
606 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0554313  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2381  hypothetical protein  24.24 
 
 
606 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>