104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1872 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  100 
 
 		 159 aa  309  1e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  72.61 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  45.75 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  38.06 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  37.74 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  37.42 
 
 		 186 aa  97.4  8e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  29.41 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  28.76 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  27.45 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  31.47 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  31.62 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  28.85 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  28.21 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  25.81 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  28.21 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  34.91 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  30.63 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  26.62 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  25.64 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  28.76 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3760  Colicin V production protein  34.27 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0367363  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  28.76 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  25.64 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  28.76 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  29.17 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1429  colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.550584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1494  colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  30.07 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2756  colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  25.93 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2833  colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.021527 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1620  Colicin V production protein  28.1 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0904729  normal  0.930325 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.47 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  31.25 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1807  Colicin V production protein  26.71 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  27.08 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  29.3 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2300  colicin V production protein  25.3 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.113958  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  24.63 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  25.49 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  26.14 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  25.69 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  25.49 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2259  colicin V production protein  24.81 
 
 		 184 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00673398  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  24.84 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  24.84 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  25 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  24.14 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  29.22 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  26.14 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  30.38 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  26.09 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  26.97 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  23.93 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0307  CvpA family protein  27.33 
 
 		 206 aa  48.1  0.00004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.617948  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  26.8 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2131  Colicin V production protein  26.09 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.519275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  26.14 
 
 		 166 aa  47.8  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  27.59 
 
 		 178 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  27.41 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  25.49 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  33.64 
 
 		 163 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  30.63 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1258  Colicin V production protein  20.78 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  26.14 
 
 		 163 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  25.49 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  26.14 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  31.06 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  27.41 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0696  colicin V production protein  25.42 
 
 		 200 aa  44.7  0.0005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.518135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  29.31 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  24.79 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1425  colicin V production protein  26.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0356  colicin V production protein  26.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1534  colicin V production protein  26.14 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.452834  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  23.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  32.58 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  25.64 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2152  colicin V production protein  27.74 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.925685  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  31.17 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  26.62 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  23.68 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4358  Colicin V production protein  22.11 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1154  Colicin V production protein  26.92 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.418061  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  25.56 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  28.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  24.16 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  25.49 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  31.45 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  25.97 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  28.29 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  28.48 
 
 		 164 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2737  colicin V production protein  35.29 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2227  Colicin V production protein  35.29 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.630839  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  30.82 
 
 		 164 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  28.03 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  29.71 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>