More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1786 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1786  dihydropteroate synthase  100 
 
 
286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0056  dihydropteroate synthase  60.88 
 
 
332 aa  356  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1514  dihydropteroate synthase  64.62 
 
 
286 aa  352  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0169529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1726  dihydropteroate synthase  58.51 
 
 
289 aa  322  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0955248  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  59.71 
 
 
300 aa  306  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0254  dihydropteroate synthase  55.3 
 
 
293 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00676186  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  46.01 
 
 
397 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  42.65 
 
 
275 aa  223  2e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  48.91 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  47.43 
 
 
291 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  46.99 
 
 
271 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  46.95 
 
 
279 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
278 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
376 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1720  dihydropteroate synthase  47.13 
 
 
265 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.270791  normal  0.815616 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  49.62 
 
 
283 aa  216  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
278 aa  215  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.86 
 
 
286 aa  216  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  49.24 
 
 
283 aa  215  8e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  41.45 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2618  dihydropteroate synthase  48.66 
 
 
292 aa  211  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.103274  normal  0.519468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  44.83 
 
 
277 aa  211  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2028  dihydropteroate synthase  45.59 
 
 
265 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  38.63 
 
 
397 aa  209  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1386  dihydropteroate synthase  50.38 
 
 
279 aa  208  9e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0675469  hitchhiker  0.00645369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.53 
 
 
280 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  42.02 
 
 
259 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 
279 aa  207  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  43.75 
 
 
291 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 
270 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1012  dihydropteroate synthase  41.58 
 
 
287 aa  206  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.561685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  40.43 
 
 
400 aa  206  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  45.15 
 
 
303 aa  206  4e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  45.82 
 
 
291 aa  206  4e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 
282 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 
277 aa  206  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  41.01 
 
 
277 aa  205  6e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  43.3 
 
 
277 aa  205  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2625  dihydropteroate synthase  46.79 
 
 
286 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.341962  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
402 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  40.84 
 
 
393 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  48.81 
 
 
299 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
277 aa  203  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.46 
 
 
266 aa  203  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
277 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4924  dihydropteroate synthase  47.33 
 
 
278 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0654969 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.49 
 
 
394 aa  203  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1616  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.282934  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2851  dihydropteroate synthase  48.72 
 
 
293 aa  202  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.668337 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1483  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0778  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0579  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.601672  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0572  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
277 aa  202  7e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1289  dihydropteroate synthase  46.47 
 
 
296 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
284 aa  201  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 
283 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  47.53 
 
 
275 aa  201  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2317  dihydropteroate synthase  46.83 
 
 
294 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  39.57 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  41.45 
 
 
283 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  40.6 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  40.84 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2775  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 
332 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0570609  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  40.6 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  43.2 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1513  dihydropteroate synthase  46.1 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0313731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
277 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0704  dihydropteroate synthase  44.36 
 
 
297 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.064336  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 
277 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  41.43 
 
 
400 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.76 
 
 
277 aa  199  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.6 
 
 
394 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.38 
 
 
277 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.38 
 
 
277 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2861  dihydropteroate synthase  44.57 
 
 
299 aa  198  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366025  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  42.4 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.31 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.31 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  42.47 
 
 
286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2169  dihydropteroate synthase  45.35 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  41 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  42.75 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  41.96 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  41.22 
 
 
285 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  43.94 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  41 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  42 
 
 
287 aa  195  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
301 aa  195  6e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>