27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2628 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  100 
 
 
591 aa  1164    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  42.91 
 
 
521 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  38.75 
 
 
517 aa  313  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  35.34 
 
 
509 aa  280  4e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  32.06 
 
 
509 aa  238  3e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  30.59 
 
 
536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  30.95 
 
 
492 aa  169  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  25.07 
 
 
550 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  22.7 
 
 
538 aa  96.3  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  24.78 
 
 
551 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  23.02 
 
 
552 aa  87.4  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  24.77 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  24.57 
 
 
558 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  26.58 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  23.62 
 
 
551 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  25.71 
 
 
548 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  23.45 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  23.43 
 
 
555 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  29.17 
 
 
586 aa  62  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  20.34 
 
 
545 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  23.78 
 
 
542 aa  60.1  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  21.94 
 
 
624 aa  57.8  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.35 
 
 
547 aa  57.4  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  24.08 
 
 
551 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  23.45 
 
 
545 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0217  hypothetical protein  25.45 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  25.55 
 
 
477 aa  43.9  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>