16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2193 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2193  protein of unknown function DUF169  100 
 
 
258 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2784  hypothetical protein  85.71 
 
 
259 aa  474  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2437  protein of unknown function DUF169  78.52 
 
 
262 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.618669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0597  hypothetical protein  70.82 
 
 
297 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1265  hypothetical protein  41.02 
 
 
270 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0531348  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2869  hypothetical protein  38.91 
 
 
270 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1866  hypothetical protein  23.85 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1231  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1923  hypothetical protein  22.63 
 
 
243 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.154092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1141  hypothetical protein  22.76 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1875  protein of unknown function DUF169  22.57 
 
 
319 aa  49.3  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2553  hypothetical protein  25.79 
 
 
269 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07530  hypothetical protein  22.9 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.369542 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21020  hypothetical protein  22.94 
 
 
250 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0919  protein of unknown function DUF169  21.88 
 
 
318 aa  42.4  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0969  hypothetical protein  23.5 
 
 
238 aa  42  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.853539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>