47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_R0091 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_R0091  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000342931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0086  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0032  tRNA-Arg  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0043  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.473325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0048  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0042  tRNA-Arg  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0110634  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0015  tRNA-Arg  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0049  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198977  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0083  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0047  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18410  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0950297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0034  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00361303  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0065  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0048  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0506396  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0069  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0017  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.233738  normal  0.0801926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0009  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.184283 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0045  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0128095  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0014  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0022  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00454117  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0049  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.428212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0047  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0045  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0020  tRNA-Arg  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0052  tRNA-Arg  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.108148  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0037  tRNA-Arg  89.8 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09170  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.155256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0018  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.594748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06030  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.936172  hitchhiker  0.000000000387483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0051  tRNA-Arg  90 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0856263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0042  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0021  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.191091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0042  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0415114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0010  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1371  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.579151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0054  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.403688  hitchhiker  0.000271304 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00815383  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0039  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.780721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0026  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0263257  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0043  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0039  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0198165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0022  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.99617  normal  0.831613 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14018  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07940  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00762126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0042  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0035  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.16654  normal  0.524865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>