33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1138 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_1138  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1425  hypothetical protein  32.69 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2236  hypothetical protein  30.98 
 
 
325 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3425  hypothetical protein  31.58 
 
 
313 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.143139  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2310  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.108131 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09383  hypothetical protein  33.8 
 
 
290 aa  145  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.474977  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1303  hypothetical protein  28.97 
 
 
312 aa  142  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00204  hypothetical protein  30.12 
 
 
310 aa  132  6e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0715  hypothetical protein  27.13 
 
 
321 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.821886  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  30.46 
 
 
380 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3651  hypothetical protein  26.25 
 
 
363 aa  56.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2508  hypothetical protein  23.93 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5378  GCN5-related N-acetyltransferase  29.53 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  28 
 
 
340 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4795  hypothetical protein  21.15 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00994712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  32.73 
 
 
346 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  30 
 
 
363 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  31.33 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  23.1 
 
 
344 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  27.15 
 
 
348 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  25.77 
 
 
368 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  19.17 
 
 
348 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  31.53 
 
 
372 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.32 
 
 
352 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  22.73 
 
 
349 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  17.67 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  21.6 
 
 
344 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  34.07 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  35.56 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  25.62 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  26.19 
 
 
369 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  22.22 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0487  hypothetical protein  23.75 
 
 
362 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>