14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3865 on replicon NC_009956
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009956  Dshi_3865  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  671    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1541  hypothetical protein  27.27 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293719 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5862  hypothetical protein  27.14 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3004  hypothetical protein  31.09 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.978043  normal  0.100274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1088 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2626  hypothetical protein  29.63 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0488948  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1453  hypothetical protein  28.06 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2290  hypothetical protein  21.85 
 
 		 322 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0467088 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1926  hypothetical protein  28.12 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0629  hypothetical protein  25.59 
 
 		 431 aa  45.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0335  hypothetical protein  25.97 
 
 		 374 aa  43.5  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0122365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3005  hypothetical protein  25.12 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0150  hypothetical protein  60 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493926  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00972  hypothetical protein  27.34 
 
 		 447 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.482043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>