More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3449 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 198 aa  389  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  54.36 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  53.93 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  52.82 
 
 		 197 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 		 207 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  54.86 
 
 		 195 aa  184  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  49.49 
 
 		 199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  48.68 
 
 		 194 aa  181  7e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  53.71 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  56.82 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  51.27 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  55.03 
 
 		 198 aa  177  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 		 199 aa  177  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  48.42 
 
 		 194 aa  176  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  56.25 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  50.79 
 
 		 194 aa  174  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  45.79 
 
 		 199 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  48.95 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  45.6 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  51.08 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  55.5 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  47.37 
 
 		 222 aa  167  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  50.29 
 
 		 201 aa  167  9e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  46.19 
 
 		 211 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  57.71 
 
 		 212 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  50.26 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48 
 
 		 204 aa  160  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  46.43 
 
 		 199 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  54.29 
 
 		 204 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  48.44 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  44.5 
 
 		 202 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  42.19 
 
 		 200 aa  149  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  54.29 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  43.88 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  48.54 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  50.86 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  46.29 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  40.74 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  41.03 
 
 		 202 aa  109  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  43.65 
 
 		 210 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  36 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3922  dephospho-CoA kinase  38.69 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0368641  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0769  dephospho-CoA kinase  38.07 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.447351  normal  0.1354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  38.58 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  38.89 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3196  dephospho-CoA kinase  39.89 
 
 		 198 aa  104  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  35.94 
 
 		 202 aa  104  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  35.68 
 
 		 200 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  36.52 
 
 		 200 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  32.95 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0844  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210259  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  36.55 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  36.55 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  38.17 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2187  dephospho-CoA kinase  38.1 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.724848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  30.21 
 
 		 197 aa  101  9e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1427  dephospho-CoA kinase  30.16 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.355175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  39.55 
 
 		 211 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0545  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0247236  normal  0.0819163 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  40.11 
 
 		 211 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  32.39 
 
 		 200 aa  99  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3111  dephospho-CoA kinase  36.87 
 
 		 214 aa  99  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4316  dephospho-CoA kinase  35.38 
 
 		 211 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  39.15 
 
 		 211 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  30.16 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  30.57 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2821  dephospho-CoA kinase  31.96 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  32.58 
 
 		 198 aa  96.3  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  35.83 
 
 		 220 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  37.5 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  36.93 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3767  dephospho-CoA kinase  34.66 
 
 		 208 aa  95.1  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.445101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4325  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 		 200 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00383074  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  36.36 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4063  dephospho-CoA kinase  31.25 
 
 		 205 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.494634 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3026  dephospho-CoA kinase  35.86 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00288343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  31.07 
 
 		 297 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  33.52 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0506  dephospho-CoA kinase  35.03 
 
 		 207 aa  94  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0667373 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3870  dephospho-CoA kinase  31.25 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  34.64 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2093  dephospho-CoA kinase  38.25 
 
 		 198 aa  93.6  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  34.54 
 
 		 200 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2821  dephospho-CoA kinase  35.59 
 
 		 202 aa  93.6  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2963  dephospho-CoA kinase  35.75 
 
 		 208 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3945  dephospho-CoA kinase  30.68 
 
 		 205 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4539  dephospho-CoA kinase  37.57 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4699  dephospho-CoA kinase  34.03 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3423e-36 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>