More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2283 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0088  steroid monooxygenase  69.17 
 
 
533 aa  780    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1351  steroid monooxygenase  60 
 
 
541 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.881234  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3461  FAD dependent oxidoreductase  69.43 
 
 
548 aa  791    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00115116  normal  0.0283002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1837  FAD dependent oxidoreductase  71.37 
 
 
547 aa  808    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0393  steroid monooxygenase  63.5 
 
 
543 aa  713    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3904  FAD dependent oxidoreductase  65.16 
 
 
548 aa  742    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.955647  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0610  steroid monooxygenase  62.66 
 
 
606 aa  711    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0189312 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2283  phenylacetone monooxygenase  100 
 
 
554 aa  1146    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0898  steroid monooxygenase  53.02 
 
 
539 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0124072  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1840  FAD dependent oxidoreductase  46.49 
 
 
573 aa  488  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.445434  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1038  cyclohexanone monooxygenase  44.98 
 
 
540 aa  475  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0813  cyclohexanone monooxygenase  44.49 
 
 
543 aa  459  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322706  normal  0.777116 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1490  putative monooxygenase  42.96 
 
 
542 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.211285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1781  cyclohexanone monooxygenase  41.07 
 
 
544 aa  449  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.177006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0330  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
540 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.282473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0320  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 
543 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0643133  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3838  cyclohexanone monooxygenase  41.07 
 
 
554 aa  444  1e-123  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7142  FAD dependent oxidoreductase  41.62 
 
 
555 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.47055  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0311  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
540 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2915  cyclohexanone monooxygenase  41.87 
 
 
546 aa  428  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.245138  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5461  flavin-containing monooxygenase FMO  42.54 
 
 
530 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5565  flavin-containing monooxygenase FMO  40.04 
 
 
539 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.192347  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4546  FAD dependent oxidoreductase  42.34 
 
 
524 aa  420  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1220  flavin-containing monooxygenase FMO  40.15 
 
 
552 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.366472  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3588  cyclohexanone monooxygenase  41.03 
 
 
540 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.558327  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1860  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 
554 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0500  cyclohexanone monooxygenase  40.3 
 
 
548 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0579  cyclohexanone monooxygenase  40.71 
 
 
559 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000280037 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0522  cyclohexanone monooxygenase  39.93 
 
 
548 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.430737  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1530  flavin-containing monooxygenase FMO  40.34 
 
 
540 aa  414  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0511  cyclohexanone monooxygenase  39.93 
 
 
548 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.016866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3429  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
544 aa  411  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0607  cyclohexanone monooxygenase  40.23 
 
 
550 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2894  cyclohexanone monooxygenase  40.99 
 
 
536 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293401  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1558  flavin-containing monooxygenase FMO  37.97 
 
 
567 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228791  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5297  FAD dependent oxidoreductase  39.88 
 
 
552 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2072  putative fusion protein  41.01 
 
 
884 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.987766  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5034  Cyclohexanone monooxygenase  39.33 
 
 
541 aa  397  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.623836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4332  cyclohexanone monooxygenase  39.74 
 
 
541 aa  391  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483661  normal  0.91016 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1837  hypothetical protein  39.45 
 
 
539 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1790  hypothetical protein  39.45 
 
 
539 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.784099  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1771  hypothetical protein  39.45 
 
 
539 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2176  cyclohexanone monooxygenase  39.02 
 
 
559 aa  386  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.665097  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2013  cyclohexanone monooxygenase  38.86 
 
 
542 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157904  normal  0.467237 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00027  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  36.07 
 
 
544 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0766369  normal  0.112462 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1480  cyclohexanone monooxygenase  37.75 
 
 
549 aa  378  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.693995  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0276  putative cyclohexanone monooxygenase  35.33 
 
 
551 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04151  steroid monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00440)  36.71 
 
 
542 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57936  Cyclopentanone 1,2-monooxygenase (CPMO)  36.33 
 
 
540 aa  369  1e-101  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03488  cyclohexanone monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G09400)  36.73 
 
 
554 aa  363  4e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0337  cyclohexanone monooxygenase  35.24 
 
 
547 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922158  normal  0.0121848 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07793  conserved hypothetical protein  37.91 
 
 
717 aa  356  5.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0510  cyclohexanone monooxygenase  38.42 
 
 
545 aa  337  5e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2102  cyclohexanone monooxygenase  35.38 
 
 
517 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200217  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05421  steroid monooxygenase (CpmA), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07490)  32.31 
 
 
542 aa  296  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465779  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3703  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 
662 aa  226  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5336  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.26 
 
 
816 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3600  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.14 
 
 
816 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.188476  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3505  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.86 
 
 
818 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0114186 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3920  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.75 
 
 
816 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  29.67 
 
 
816 aa  212  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1697  monooxygenase FAD-binding protein  32.75 
 
 
605 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.293831 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37380  putative flavin-binding monooxygenase  31.76 
 
 
491 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000202152  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4867  Cyclohexanone monooxygenase  33.33 
 
 
653 aa  208  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.13 
 
 
506 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.685298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4961  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
613 aa  206  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2671  cyclohexanone monooxygenase  29.78 
 
 
498 aa  205  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558971  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4492  cyclohexanone monooxygenase  30.39 
 
 
611 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315924  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4405  cyclohexanone monooxygenase  30.39 
 
 
611 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.339327  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4786  cyclohexanone monooxygenase  30.49 
 
 
611 aa  203  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2415  cyclohexanone monooxygenase  31.36 
 
 
497 aa  204  5e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1273  putative flavin-binding monooxygenase-like protein  29.66 
 
 
493 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7122  flavin-containing monooxygenase FMO  29.27 
 
 
490 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2374  cyclohexanone monooxygenase  31.14 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.845854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2421  cyclohexanone monooxygenase  31.14 
 
 
498 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.423318  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11422  monoxygenase  29.09 
 
 
491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.178527  normal  0.251324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3696  hypothetical protein  29.68 
 
 
608 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.761481  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16420  predicted flavoprotein involved in K+ transport  29.88 
 
 
525 aa  201  3.9999999999999996e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1890  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  29.42 
 
 
491 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0239259  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3530  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.18 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28920  predicted flavoprotein involved in K+ transport  32.62 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.264104 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0043  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.94 
 
 
487 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3012  Cyclohexanone monooxygenase  30.56 
 
 
540 aa  196  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1834  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.61 
 
 
484 aa  195  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.112506  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1956  putative flavin-binding monooxygenase-like  30.16 
 
 
496 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340923  normal  0.160149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3359  Cyclohexanone monooxygenase  30.56 
 
 
548 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562542  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1165  cyclohexanone monooxygenase  29.34 
 
 
604 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.785376  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1636  Phenylacetone monooxygenase  30.56 
 
 
603 aa  194  5e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.672961  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1789  cyclohexanone monooxygenase  30.66 
 
 
614 aa  193  8e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0573  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 
496 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.230445  hitchhiker  0.00837864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0561  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 
496 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0551  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.69 
 
 
496 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.635944  normal  0.310204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3256  putative monooxygenase  29.13 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3203  putative monooxygenase  29.13 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0255813  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3194  putative monooxygenase  29.13 
 
 
505 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0184  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.51 
 
 
495 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1088  flavoprotein involved in K+ transport-like protein  30.77 
 
 
499 aa  190  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.437859  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00025  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 
603 aa  189  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.338979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4546  Cyclohexanone monooxygenase  29.27 
 
 
503 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.995247  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0977  putative flavin-binding monooxygenase  29.43 
 
 
499 aa  188  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.321633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>