15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1928 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1928  conserved hypothetical protein DUF484  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0343023  hitchhiker  0.0000000244023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1223  hypothetical protein  54.87 
 
 		 229 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540946  normal  0.173765 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0562  hypothetical protein  54.42 
 
 		 229 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.536888  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2214  hypothetical protein  53.98 
 
 		 229 aa  244  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1031  hypothetical protein  54.19 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2380  hypothetical protein  51.11 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2500  hypothetical protein  43.17 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.392304  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1458  hypothetical protein  31.47 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2808  hypothetical protein  30.53 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1221  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0185278  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0239  hypothetical protein  29.88 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0893238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0221  hypothetical protein  28.87 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  26.72 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  27.13 
 
 		 227 aa  42  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>