37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0565 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  676    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  52.41 
 
 		 342 aa  327  3e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  49.26 
 
 		 338 aa  316  4e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  47.59 
 
 		 329 aa  249  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  46.3 
 
 		 332 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  47.59 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  29.83 
 
 		 358 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.48 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  26.83 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  28.45 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  28.45 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  27.83 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  26.44 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  26.2 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  25.57 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  26.72 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  25.48 
 
 		 345 aa  89.4  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  26.6 
 
 		 335 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  26.65 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  24.78 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 354 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  24.86 
 
 		 354 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  28.13 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  25.44 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  23.88 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  22.69 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  22.54 
 
 		 366 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  24.5 
 
 		 380 aa  67.4  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  22.63 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  21.36 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  21.97 
 
 		 356 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  20.17 
 
 		 378 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  24.12 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1330  periplasmic lipoprotein  20.61 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  25.46 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>