17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3049 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3049  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2095  hypothetical protein  47.22 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2670  hypothetical protein  32.35 
 
 		 319 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.402789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  31.15 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2581  N-terminal methylation site  41.86 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0878  N-terminal methylation motif domain protein  26.98 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0877  N-terminal methylation motif domain protein  25.4 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  28.57 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0745  hypothetical protein  35.85 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.836377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3886  type II secretion system protein G  30.12 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  30.77 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0719  type IV pilin  30.77 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.176419 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0681  type-IV pilin  26.97 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2572  putative type IV pilin  34.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0664  type-IV pilin  26.97 
 
 		 149 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0534  hypothetical protein  42.55 
 
 		 140 aa  40  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2274  prepilin peptidase dependent protein A precursor  32.39 
 
 		 140 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>