33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2326 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2326  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0802  hypothetical protein  41.55 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1046  hypothetical protein  41.26 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0430  hypothetical protein  45.95 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000822296  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1914  hypothetical protein  38.67 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000181439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0018  Rho termination factor-like  34.31 
 
 		 731 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4273  Rho termination factor-like  33.58 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112471  normal  0.307115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0971  hypothetical protein  30.06 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471118  normal  0.38482 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1966  Rho termination factor domain protein  32.85 
 
 		 420 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0338  hypothetical protein  33.58 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0675  Rho termination factor domain protein  31.62 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.710202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0496  Rho termination factor domain protein  31.39 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0333729 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0483  Rho termination factor domain protein  31.39 
 
 		 387 aa  79  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1331  uncharacterized protein-like protein  32.86 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000236749  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2035  Rho termination factor domain-containing protein  29.93 
 
 		 416 aa  75.1  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0823  hypothetical protein  30.6 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0868  uncharacterized protein-like protein  30.88 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1355  hypothetical protein  31.43 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000306727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16010  hypothetical protein  25.84 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02991  hypothetical protein  29.21 
 
 		 365 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.865634 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2288  hypothetical protein  28.69 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.757361  normal  0.0680971 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0398  hypothetical protein  27.87 
 
 		 363 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0205741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0077  hypothetical protein  26.23 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00841  hypothetical protein  31.82 
 
 		 368 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00871  hypothetical protein  26.13 
 
 		 366 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1438  hypothetical protein  28.93 
 
 		 360 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.917443  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01391  hypothetical protein  28.93 
 
 		 360 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00841  hypothetical protein  26.23 
 
 		 365 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0857  putative phosphate transport system substrate-binding protein  24.79 
 
 		 1035 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275371 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00861  hypothetical protein  27.59 
 
 		 361 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0589  uncharacterized protein-like protein  22.56 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3087  hypothetical protein  24.46 
 
 		 450 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0098  hypothetical protein  27.59 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.888213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>