172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2006 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0507  putative serine protein kinase, PrkA  73.38 
 
 
631 aa  974    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0168662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1372  putative serine protein kinase, PrkA  72.9 
 
 
631 aa  981    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0605  hypothetical protein  72.58 
 
 
631 aa  980    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0518  hypothetical protein  72.42 
 
 
631 aa  978    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0461  serine protein kinase  72.42 
 
 
631 aa  978    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0457  serine protein kinase  72.42 
 
 
631 aa  978    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0550  hypothetical protein  72.42 
 
 
631 aa  978    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0510  putative serine protein kinase, PrkA  76.86 
 
 
630 aa  1019    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0625  hypothetical protein  72.58 
 
 
631 aa  980    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0460  putative serine protein kinase, PrkA  76.42 
 
 
632 aa  1022    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2006  putative serine protein kinase, PrkA  100 
 
 
631 aa  1293    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0472  putative serine protein kinase, PrkA  72.42 
 
 
631 aa  977    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0586  hypothetical protein  72.42 
 
 
631 aa  979    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4752  hypothetical protein  72.42 
 
 
631 aa  979    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0550  hypothetical protein  72.42 
 
 
631 aa  978    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.95802e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3006  putative serine protein kinase, PrkA  71.88 
 
 
633 aa  976    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0465  putative serine protein kinase, PrkA  72.42 
 
 
631 aa  979    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0591  putative serine protein kinase, PrkA  70.36 
 
 
631 aa  967    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1156  putative serine protein kinase, PrkA  84.47 
 
 
631 aa  1123    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1073  putative serine protein kinase, PrkA  63.33 
 
 
626 aa  872    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2210  putative serine protein kinase, PrkA  43.34 
 
 
694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3529  putative serine protein kinase, PrkA  43.71 
 
 
692 aa  514  1e-144  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.585407  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1379  putative serine protein kinase, PrkA  43.81 
 
 
692 aa  515  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1230  putative serine protein kinase, PrkA  42.71 
 
 
690 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2635  putative serine protein kinase, PrkA  42.4 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0964648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2537  putative serine protein kinase, PrkA  42.4 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.387634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4175  putative serine protein kinase, PrkA  41.81 
 
 
692 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.170003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2729  putative serine protein kinase, PrkA  42.4 
 
 
690 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1334  serine protein kinase  41.94 
 
 
640 aa  500  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.175734  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1541  serine protein kinase  41.94 
 
 
640 aa  497  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4656  putative serine protein kinase, PrkA  41.15 
 
 
681 aa  498  1e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.234719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1821  putative serine protein kinase, PrkA  39.24 
 
 
709 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0916843  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1205  putative serine protein kinase, PrkA  40.43 
 
 
642 aa  482  1e-135  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0489  putative serine protein kinase, PrkA  41.43 
 
 
644 aa  476  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2989  PrkA AAA domain protein  41.04 
 
 
681 aa  473  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2509  PrkA serine kinase  41.36 
 
 
643 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00245056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3367  putative serine protein kinase, PrkA  30.92 
 
 
690 aa  309  8e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2231  putative serine protein kinase, PrkA  30.22 
 
 
690 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.795267  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1750  putative serine protein kinase, PrkA  30.28 
 
 
690 aa  302  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0032  putative serine protein kinase, PrkA  30.22 
 
 
691 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0177084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0412  putative serine protein kinase, PrkA  30.09 
 
 
690 aa  296  9e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34499  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3779  hypothetical protein  32.76 
 
 
640 aa  293  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0881  putative serine protein kinase, PrkA  33.23 
 
 
640 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2157  putative serine protein kinase, PrkA  32.86 
 
 
640 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2704  putative serine protein kinase, PrkA  33.54 
 
 
640 aa  290  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1625  putative serine protein kinase, PrkA  32.76 
 
 
640 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1232  putative Serine protein kinase, PrkA  33.22 
 
 
639 aa  287  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1133  putative serine protein kinase, PrkA  34.46 
 
 
640 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.448635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1613  putative serine protein kinase, PrkA  34.46 
 
 
640 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2387  putative serine protein kinase, PrkA  33.72 
 
 
640 aa  286  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203213  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1589  putative serine protein kinase, PrkA  34.28 
 
 
640 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.563903 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1710  putative serine protein kinase, PrkA  31.29 
 
 
640 aa  283  8.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376302  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2217  putative serine protein kinase, PrkA  32.48 
 
 
640 aa  283  9e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2025  protein kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1691  PrkA serine kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01689  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0347  serine protein kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1861  serine protein kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1873  serine protein kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0814  protein kinase  32.13 
 
 
640 aa  282  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125388  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4751  putative serine protein kinase, PrkA  33.93 
 
 
640 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.734625  normal  0.263656 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0733  putative serine protein kinase, PrkA  33.76 
 
 
640 aa  281  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0532  putative serine protein kinase, PrkA  33.16 
 
 
644 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.374476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1528  putative serine protein kinase, PrkA  33.75 
 
 
640 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629451  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1510  putative serine protein kinase, PrkA  33.75 
 
 
640 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292575  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2567  putative serine protein kinase, PrkA  32.8 
 
 
640 aa  281  4e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2820  putative serine protein kinase, PrkA  31.8 
 
 
647 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.437812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0428  putative serine protein kinase, PrkA  34.68 
 
 
640 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0371656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0397  putative serine protein kinase, PrkA  34.68 
 
 
640 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2005  putative Serine protein kinase, PrkA  32.13 
 
 
640 aa  280  7e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329127  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0431  putative serine protein kinase, PrkA  34.68 
 
 
640 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.219182  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3904  putative serine protein kinase  32.44 
 
 
640 aa  280  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.370325 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3553  putative serine protein kinase, PrkA  32.65 
 
 
640 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3056  putative serine protein kinase, PrkA  34.22 
 
 
640 aa  279  1e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.651845  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4017  putative serine protein kinase, PrkA  33.02 
 
 
640 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46870  serine protein kinase; PrkA  32.86 
 
 
640 aa  279  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2050  putative serine protein kinase, PrkA  33.81 
 
 
640 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0255  putative serine protein kinase, PrkA  33.68 
 
 
649 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2257  putative serine protein kinase, PrkA  31.97 
 
 
640 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0112487  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1742  putative serine protein kinase, PrkA  33.81 
 
 
640 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375663  normal  0.534175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2561  putative serine protein kinase, PrkA  31.68 
 
 
647 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105653  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003981  hypothetical protein  34.45 
 
 
644 aa  277  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02751  putative serine protein kinase, PrkA  33.68 
 
 
640 aa  277  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.405068  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1229  putative serine protein kinase, PrkA  33.39 
 
 
640 aa  277  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.237097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07680  hypothetical protein  35.38 
 
 
640 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.115546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2469  protein kinase  32.29 
 
 
640 aa  276  7e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2856  hypothetical protein  34.45 
 
 
643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2725  hypothetical protein  34.45 
 
 
643 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6314  hypothetical protein  32.99 
 
 
580 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192005  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0731  hypothetical protein  35.38 
 
 
640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4805  putative serine protein kinase, PrkA  34.33 
 
 
640 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.900431  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01541  hypothetical protein  34.39 
 
 
644 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3963  putative serine protein kinase, PrkA  31.39 
 
 
650 aa  273  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4631  PrkA serine kinase  32.39 
 
 
640 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.235563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0547  hypothetical protein  33.98 
 
 
640 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0199  putative serine protein kinase, PrkA  33.27 
 
 
640 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.392588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6236  putative serine protein kinase, PrkA  32.59 
 
 
648 aa  272  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283326  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2327  putative serine protein kinase, PrkA  31.13 
 
 
640 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0509152  normal  0.762867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1396  serine protein kinase PrkA  32.7 
 
 
644 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355839 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1412  serine protein kinase, PrkA  32.7 
 
 
644 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.405846  normal  0.417288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1379  serine protein kinase, PrkA  32.7 
 
 
644 aa  271  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.392186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>