265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1236 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1236  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
438 aa  852    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0770  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.09 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0808  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.29 
 
 
428 aa  352  5e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.10386  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1207  xanthine/uracil/vitamin C permease  32.35 
 
 
436 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4601  xanthine/uracil permease family protein  26.59 
 
 
435 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4239  xanthine/uracil permease family protein  27.6 
 
 
431 aa  107  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4627  xanthine/uracil permease family protein  27.07 
 
 
442 aa  107  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.124277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4227  xanthine/uracil permease family protein  26.76 
 
 
431 aa  106  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4330  xanthine/uracil/vitamin C permease  27.64 
 
 
431 aa  106  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4913  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.25 
 
 
426 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4725  xanthine/uracil permease family protein  27.38 
 
 
434 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.536071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4386  xanthine/uracil permease family protein  27.38 
 
 
431 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.694966  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0625  xanthine permease  26.86 
 
 
428 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0012  xanthine/uracil permease family protein  26.13 
 
 
426 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5188  xanthine/uracil/vitamin C permease  26.1 
 
 
427 aa  103  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4604  xanthine/uracil permease family protein  27.97 
 
 
434 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5076  xanthine/uracil permease family protein  25.35 
 
 
433 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000323201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5247  xanthine/uracil permease family protein  25.35 
 
 
433 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5093  xanthine/uracil permease family protein  25.4 
 
 
427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5645  xanthine/uracil permease family protein  25.35 
 
 
433 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5490  xanthine/uracil permease family protein  25.4 
 
 
427 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5433  xanthine/uracil permease family protein  25.06 
 
 
427 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4630  xanthine/uracil permease family protein  27.97 
 
 
431 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1511  uracil-xanthine permease  26.55 
 
 
413 aa  99  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0982636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4610  xanthine permease  26.92 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3916  xanthine/uracil/vitamin C permease  27.05 
 
 
436 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2514  xanthine/uracil/vitamin C permease  24.22 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317709  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5524  xanthine/uracil permease family protein  24.59 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5574  xanthine/uracil permease family protein  25.18 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5518  xanthine/uracil permease family protein  24.59 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1592  xanthine permease  26.24 
 
 
438 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  24.22 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  24.06 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2262  Xanthine/uracil/vitamin C permease  26.4 
 
 
431 aa  89.7  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000000390062  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0206  uracil-xanthine permease  25.53 
 
 
413 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.202114  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0895  uracil-xanthine permease  25.8 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1705  uracil-xanthine permease  25.27 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.297144  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3100  Xanthine/uracil/vitamin C permease  23.71 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3110  putative purine permease YbbY  23.71 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.39747 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0586  putative purine permease YbbY  23.71 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0614  putative purine permease YbbY  23.71 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3928  xanthine permease  22.47 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.570861  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00463  predicted uracil/xanthine transporter  23.47 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00468  hypothetical protein  23.47 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0550  putative purine permease YbbY  23.71 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1667  xanthine permease  26.78 
 
 
450 aa  81.3  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  23.2 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2284  xanthine/uracil permease family protein  25.05 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3109  uracil-xanthine permease  22.3 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.74503  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0572  putative purine permease YbbY  24.19 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  23.02 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0631  putative purine permease YbbY  24.59 
 
 
432 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  24.44 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0577  putative purine permease YbbY  24.36 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  25.12 
 
 
507 aa  73.9  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.740673  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1425  xanthine permease  25 
 
 
449 aa  73.9  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000466476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0570  putative purine permease YbbY  24.36 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1007  Xanthine/uracil/vitamin C permease  24.88 
 
 
533 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  23.03 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2645  uracil-xanthine permease  25.06 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0418  Xanthine/uracil/vitamin C permease  23.87 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  25.41 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2118  uracil-xanthine permease  23.64 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.398858  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1399  Xanthine/uracil/vitamin C permease  23.84 
 
 
450 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  21.14 
 
 
825 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  22.76 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  21.75 
 
 
633 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00623  hypothetical protein  24.41 
 
 
463 aa  66.6  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0933  xanthine/uracil permease  24.11 
 
 
428 aa  66.2  0.0000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3915  xanthine permease  23.95 
 
 
462 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.53056 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3408  uracil-xanthine permease  23.95 
 
 
462 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal  0.0616677 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3234  xanthine/uracil/vitamin C permease  21.37 
 
 
577 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0701  xanthine/uracil permease family protein  27.84 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  21.56 
 
 
458 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001868  xanthine/uracil permease family protein  23.77 
 
 
462 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1726  uracil-xanthine permease  22.17 
 
 
452 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0864  xanthine/uracil permease-like protein  24.6 
 
 
566 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  23.23 
 
 
442 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  24.19 
 
 
431 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3725  uracil-xanthine permease  23.9 
 
 
445 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  23.76 
 
 
440 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4364  uracil-xanthine permease  23.88 
 
 
462 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4002  uracil-xanthine permease  23.88 
 
 
462 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3521  xanthine permease  23.88 
 
 
462 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.964115  normal  0.563042 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2522  xanthine permease  22.77 
 
 
449 aa  63.2  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0140814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4581  xanthine permease  24.39 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2003  uracil-xanthine permease  22.17 
 
 
466 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2088  xanthine/uracil transporter  23.82 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.365471  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  23.24 
 
 
459 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  24.75 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  22.22 
 
 
489 aa  62  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  23.27 
 
 
469 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  24.81 
 
 
471 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1913  uracil-xanthine permease  28.64 
 
 
468 aa  62.4  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00677424  normal  0.0587093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  22.42 
 
 
640 aa  62.4  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0943  uracil-xanthine permease  23.93 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  24.2 
 
 
440 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3177  Xanthine/uracil/vitamin C permease  22.57 
 
 
528 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  25.46 
 
 
427 aa  61.6  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  24.4 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>