237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0560 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0560  phosphodiesterase  100 
 
 
239 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1957  phosphodiesterase  46.41 
 
 
240 aa  239  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0943  phosphodiesterase  46.67 
 
 
254 aa  224  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.461834  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0921  phosphodiesterase  46.25 
 
 
254 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00301571  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0484  phosphodiesterase  42.62 
 
 
259 aa  203  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2821  Ser/Thr protein phosphatase family protein  40.26 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0587  hypothetical protein  85.26 
 
 
139 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2507  Ser/Thr protein phosphatase family protein  39.83 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0768  phosphodiesterase  41.42 
 
 
259 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4423  metallophosphoesterase  35.29 
 
 
244 aa  168  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3084  metallophosphoesterase  34.9 
 
 
244 aa  165  5e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2988  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
636 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11491  hypothetical protein  34.12 
 
 
271 aa  159  5e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.112711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3845  metallophosphoesterase  34.9 
 
 
271 aa  158  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1343  hypothetical protein  34.12 
 
 
271 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0233  hypothetical protein  36.73 
 
 
264 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15841  hypothetical protein  33.72 
 
 
296 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0619  metallophosphoesterase  35.32 
 
 
265 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1568  hypothetical protein  34.12 
 
 
271 aa  155  8e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4611  metallophosphoesterase  32.57 
 
 
271 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1958  metallophosphoesterase  35.54 
 
 
222 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3746  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.42 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2290  metallophosphoesterase  33.71 
 
 
253 aa  135  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1073  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.62 
 
 
222 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.063747  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.19 
 
 
219 aa  133  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1363  metallophosphoesterase  31.56 
 
 
240 aa  131  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0352046  hitchhiker  0.00042748 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1019  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.2 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2851  metallophosphoesterase  33.2 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00538078  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0140  putative serine/threonine protein phosphatase  31.82 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2718  metallophosphoesterase  32.8 
 
 
241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2789  serine/threonine protein phosphatase  32.41 
 
 
247 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3096  phosphatase family protein  32.41 
 
 
247 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0003834  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2182  phosphatase family protein  31.62 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.711182  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0757  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.42 
 
 
234 aa  124  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.496407 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3099  phosphatase family protein  32.42 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.261836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2857  phosphatase family protein  32.02 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2829  serine/threonine protein phosphatase  32.02 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0808  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
241 aa  124  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3071  phosphatase family protein  32.02 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.448592  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3080  phosphatase family protein  32.02 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1957  CHAD domain containing protein  33.48 
 
 
681 aa  122  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0194  radical SAM domain-containing protein  26.78 
 
 
579 aa  122  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.369341  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3115  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5021  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.745206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5252  metallophosphoesterase  31.54 
 
 
244 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1140  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
236 aa  119  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.292913  normal  0.193072 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1856  metallophosphoesterase  30.47 
 
 
252 aa  119  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.733001  normal  0.937707 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1085  metallophosphoesterase  35.88 
 
 
243 aa  118  7e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.307111  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3065  phosphatase family protein  32.62 
 
 
247 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2046  metallophosphoesterase  30.58 
 
 
246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.489045  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5140  metallophosphoesterase  31.15 
 
 
244 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.157126  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0401  metallophosphoesterase  30.38 
 
 
244 aa  115  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.87 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4612  metallophosphoesterase  30.77 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3378  hypothetical protein  26.78 
 
 
595 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0273  metallophosphoesterase  30.9 
 
 
281 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0656  metallophosphoesterase  28.22 
 
 
240 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3461  metallophosphoesterase  30.12 
 
 
244 aa  112  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.122821  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0369  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.44 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0867019  normal  0.227919 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1710  metallophosphoesterase  30.95 
 
 
241 aa  111  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0540724  normal  0.136885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1521  phosphoesterase  30.7 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4162  metallophosphoesterase  30.71 
 
 
243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.314621  normal  0.159324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3758  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5302  metallophosphoesterase  33.47 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8738  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0139  metallophosphoesterase  31.7 
 
 
260 aa  108  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.18757  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0264  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
252 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.662192 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_346  serine/threonine protein phosphatase  28.96 
 
 
297 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3589  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
247 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.242712  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1711  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
247 aa  105  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.341536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1757  metallophosphoesterase  30 
 
 
246 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0422  metallophosphoesterase  27.34 
 
 
266 aa  105  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00658037  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0090  metallophosphoesterase  27.55 
 
 
263 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.681848  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2118  metallophosphoesterase  29.39 
 
 
246 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3700  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
250 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2263  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
250 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.985376  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2886  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
268 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.108757  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1839  metallophosphoesterase  29.77 
 
 
246 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2813  metallophosphoesterase  30.96 
 
 
236 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09700  predicted phosphoesterase  30.4 
 
 
257 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1866  metallophosphoesterase  28.24 
 
 
246 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.144695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3841  metallophosphoesterase  30.65 
 
 
248 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.255668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0846  metallophosphoesterase  28.63 
 
 
244 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.537551  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3653  phosphodiesterase  28.51 
 
 
238 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0619725  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4135  metallophosphoesterase  30 
 
 
268 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0557704  hitchhiker  0.00370381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1489  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
246 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3372  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.51 
 
 
234 aa  100  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.884853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0403  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.08 
 
 
243 aa  100  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1179  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.77 
 
 
235 aa  99  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5337  hypothetical protein  25.57 
 
 
246 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.274329 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1737  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
242 aa  99  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2829  metallophosphoesterase  27.27 
 
 
304 aa  99  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal  0.209971 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2071  metallophosphoesterase  30.8 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.654149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3469  serine/threonine protein phosphatase family protein  29.41 
 
 
245 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1287  metallophosphoesterase  27.56 
 
 
241 aa  98.2  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000190987  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4430  hypothetical protein  30.52 
 
 
246 aa  98.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.861284  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3861  metallophosphoesterase  28.52 
 
 
246 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.718342  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2227  metallophosphoesterase  30.62 
 
 
244 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.908069  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3810  metallophosphoesterase  27.86 
 
 
246 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2315  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00926311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1877  metallophosphoesterase  29.6 
 
 
293 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal  0.551763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>