32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1710 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1710  GHMP kinase  100 
 
 		 350 aa  718    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2431  GHMP kinase  25.58 
 
 		 343 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.696498  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0617  GHMP kinase  24.15 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.170003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3668  GHMP kinase  28.65 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0374  GHMP kinase  23.85 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.638274  normal  0.807327 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4217  GHMP kinase  30.53 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  27.4 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0447  GHMP kinase  29.45 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3581  GHMP kinase  31.21 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0236  GHMP kinase  25.73 
 
 		 350 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3592  GHMP kinase  26.87 
 
 		 354 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.437274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0952  GHMP kinase  27.1 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.70731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1374  GHMP kinase  30.77 
 
 		 337 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0315  mevalonate kinase  21.9 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5597  GHMP kinase  27.17 
 
 		 326 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06460  galactokinase  26.09 
 
 		 439 aa  47  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  23.8 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1227  GHMP kinase  24.12 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0620  phosphomevalonate kinase  24.82 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.373049  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2647  GHMP kinase  28.67 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1662  GHMP kinase  24.88 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1635  GHMP kinase  24.88 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0721  mevalonate kinase  24.82 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00059401  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4245  GHMP kinase  29.65 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.469148 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  27.06 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1424  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  23.4 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.878412  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1201  Galactokinase  28.81 
 
 		 410 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0153  GHMP kinase  31.31 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1759  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  23.11 
 
 		 339 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.44471  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  28.65 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1610  capsular biosynthesis sugar kinase, putative  22.64 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.594755  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0891  mevalonate kinase  26.8 
 
 		 322 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>