28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1025 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1044    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  32.16 
 
 
509 aa  258  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  31.26 
 
 
591 aa  223  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  30.85 
 
 
517 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  29.63 
 
 
521 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  28.24 
 
 
492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  25.34 
 
 
536 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  23.45 
 
 
545 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  23.34 
 
 
551 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  20.88 
 
 
551 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  22.95 
 
 
552 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  21.04 
 
 
551 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  21.43 
 
 
550 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  24.6 
 
 
547 aa  90.5  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  21.83 
 
 
538 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  24.07 
 
 
550 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  21.21 
 
 
545 aa  77.4  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  25.33 
 
 
555 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  24.56 
 
 
542 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  20.81 
 
 
558 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  21.47 
 
 
548 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  25.23 
 
 
586 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  21.97 
 
 
552 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  22.18 
 
 
551 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  22.09 
 
 
624 aa  60.5  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  21.12 
 
 
473 aa  53.9  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  24.39 
 
 
461 aa  51.6  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  27.21 
 
 
553 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>