41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2205 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  100 
 
 
221 aa  456  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0789  hypothetical protein  33.48 
 
 
238 aa  116  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.995984 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2209  hypothetical protein  60.87 
 
 
106 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  26.02 
 
 
220 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  26.53 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  36.07 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  26.87 
 
 
224 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  38.61 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  29.45 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  31.09 
 
 
221 aa  73.6  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  42.67 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  33.1 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  34.17 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  26.84 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  37.04 
 
 
230 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  36.7 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  28.68 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  32.58 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  34.44 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  31.67 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  25.69 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  40 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  34.48 
 
 
242 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  24.34 
 
 
241 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  31.62 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  29.46 
 
 
235 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  24.07 
 
 
241 aa  54.3  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  31 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  29.63 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  26.79 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  29.37 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  30 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  26.03 
 
 
231 aa  52.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  23.11 
 
 
241 aa  51.6  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  29.41 
 
 
241 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  23.61 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  31.33 
 
 
228 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  29.63 
 
 
234 aa  48.5  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5551  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  31.17 
 
 
808 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325824  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  27.16 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>