28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2441 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  100 
 
 		 643 aa  1268    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  42.62 
 
 		 900 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  37.86 
 
 		 1129 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  27.18 
 
 		 2412 aa  77.8  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1285 aa  72  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  27.64 
 
 		 975 aa  57.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  27.64 
 
 		 939 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.49 
 
 		 2656 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  30.46 
 
 		 5203 aa  50.8  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  29.89 
 
 		 3373 aa  48.9  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  37.04 
 
 		 3634 aa  48.5  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  37.04 
 
 		 2078 aa  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1236 aa  47.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0849  hypothetical protein  34.95 
 
 		 740 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0608  hypothetical protein  37.14 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0969981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  28.57 
 
 		 733 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1482 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2544  hypothetical protein  34.95 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7801  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2401  hypothetical protein  34.95 
 
 		 649 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.612705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  26.67 
 
 		 1108 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  27.96 
 
 		 2112 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1502  hypothetical protein  34.95 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0321  hypothetical protein  34.95 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0355  hypothetical protein  34.95 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1698  hypothetical protein  34.95 
 
 		 620 aa  45.8  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  29.03 
 
 		 2876 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.36 
 
 		 924 aa  43.9  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  29.84 
 
 		 775 aa  43.9  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>