14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3958 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3958  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 
662 aa  1367    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.44446  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0192  hypothetical protein  35.99 
 
 
680 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0160216  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2589  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.84 
 
 
661 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541867  normal  0.205494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2863  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  30.98 
 
 
672 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.515919  normal  0.787777 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  32.76 
 
 
1414 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  30.86 
 
 
669 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  31.4 
 
 
1771 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.06 
 
 
2334 aa  48.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  30.34 
 
 
243 aa  47.8  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  30.3 
 
 
846 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  25.85 
 
 
1386 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  27.78 
 
 
1093 aa  45.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  27.78 
 
 
461 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04405  hypothetical protein  34.48 
 
 
469 aa  43.9  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>