190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2253 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  100 
 
 
437 aa  904    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  28.47 
 
 
466 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  29.6 
 
 
419 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  28.08 
 
 
445 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  28.08 
 
 
451 aa  160  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  27.78 
 
 
451 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  27.15 
 
 
428 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  26.33 
 
 
482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  26.11 
 
 
459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  25.11 
 
 
451 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  26.14 
 
 
456 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  25.54 
 
 
461 aa  104  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  27.68 
 
 
451 aa  103  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  25.97 
 
 
480 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0346  amidohydrolase  23.76 
 
 
416 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.28 
 
 
441 aa  96.3  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  24.4 
 
 
501 aa  94.7  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  23.63 
 
 
487 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  23.23 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  25.65 
 
 
414 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  22.69 
 
 
434 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  23.1 
 
 
466 aa  87  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  21.94 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  22.6 
 
 
504 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1915  amidohydrolase  25.46 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00232567  normal  0.102109 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  22.25 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  23.27 
 
 
448 aa  77.8  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0930  amidohydrolase  21.69 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000429502  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  20.84 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  23.43 
 
 
422 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  23.43 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  20.66 
 
 
466 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  21.27 
 
 
520 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  20.43 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1566  amidohydrolase  20.69 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  30 
 
 
476 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  21.86 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0677  amidohydrolase  24.22 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  22.61 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  23 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  22.17 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  21.72 
 
 
422 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1336  amidohydrolase  24.38 
 
 
451 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00395151 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1260  amidohydrolase  19.55 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0532  amidohydrolase  21.38 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0768  amidohydrolase  24.53 
 
 
442 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0368346  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  22.51 
 
 
441 aa  63.9  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1262  amidohydrolase  22.75 
 
 
453 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0914748 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  21.43 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1376  amidohydrolase  20.96 
 
 
427 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000571224 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  23.6 
 
 
454 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2167  amidohydrolase  19.47 
 
 
436 aa  63.2  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0888971  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  21.23 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  19.35 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2776  amidohydrolase  24.92 
 
 
457 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0301314  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4281  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.81 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.142354  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  23.99 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  29.1 
 
 
490 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  21.24 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.25 
 
 
484 aa  60.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0758  amidohydrolase  24.3 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.25 
 
 
451 aa  61.2  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  26.32 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2226  amidohydrolase  20.98 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.306812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  22.97 
 
 
447 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  21.8 
 
 
454 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2038  amidohydrolase  19.71 
 
 
422 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2541  amidohydrolase  22.64 
 
 
457 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0448318  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1721  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.84 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.474668  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1737  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  21.4 
 
 
443 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08593  chlorohydrolase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00460)  23.78 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1591  N-ethylammeline chlorohydrolase  31.47 
 
 
241 aa  57.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  24.32 
 
 
442 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2773  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  21.74 
 
 
446 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  21.77 
 
 
445 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2061  amidohydrolase  22.77 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000262126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0548  Guanine deaminase  25.52 
 
 
440 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194009 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2016  amidohydrolase  21.7 
 
 
481 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2080  N-ethylammeline chlorohydrolase  26.67 
 
 
436 aa  57  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0556  amidohydrolase  20.72 
 
 
428 aa  57  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.216303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1806  amidohydrolase  22.67 
 
 
406 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0549  amidohydrolase  20.61 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000560695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2226  amidohydrolase  24.51 
 
 
453 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330623 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1366  amidohydrolase  21.01 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.376571  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.67 
 
 
440 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  37.21 
 
 
509 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1335  amidohydrolase  23.19 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0654  amidohydrolase  17.87 
 
 
423 aa  54.3  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0240441  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03194  conserved hypothetical protein  21.89 
 
 
464 aa  54.3  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  22.14 
 
 
461 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1148  amidohydrolase  25.4 
 
 
481 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal  0.452505 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1087  amidohydrolase  22.18 
 
 
435 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0260  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  20.65 
 
 
453 aa  53.1  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1419  amidohydrolase  21.5 
 
 
656 aa  53.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1844  amidohydrolase  21.67 
 
 
405 aa  52.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1605  N-formimino-L-glutamate deiminase  23.21 
 
 
457 aa  53.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.544919  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1054  hypothetical protein  21.19 
 
 
434 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.587451  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0120  amidohydrolase  21.01 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf580  cytosine deaminase  22.34 
 
 
435 aa  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.239245  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1273  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.73 
 
 
438 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>