38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2036 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 231 aa  474  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  57.64 
 
 		 230 aa  291  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  42.86 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  42.24 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  40.08 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 237 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  30.26 
 
 		 237 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  33.48 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  28.15 
 
 		 236 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  28.63 
 
 		 239 aa  98.6  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  28.51 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  27.63 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 217 aa  92  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 235 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  25.98 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  27.05 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  27.83 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  23.35 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  24.5 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  23.72 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 221 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  24.19 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 352 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2045  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 267 aa  48.9  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000233397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2173  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3390  hypothetical protein  23.35 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3235  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0230  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.183914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  32 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 233 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3746  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  30.48 
 
 		 258 aa  42.4  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  30.65 
 
 		 231 aa  41.6  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>