54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1830 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1830  Multimeric flavodoxin WrbA-like protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00348996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0810  BRAMP  36.94 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.22904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2572  hypothetical protein  41.74 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2564  hypothetical protein  41.74 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2527  hypothetical protein  41.74 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2077  BRAMP  36.31 
 
 		 216 aa  97.8  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00766184  normal  0.590504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3009  hypothetical protein  38.31 
 
 		 249 aa  95.5  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.932939  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1969  hypothetical protein  30.14 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.256176  normal  0.256404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4745  hypothetical protein  31.21 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4864  hypothetical protein  32.88 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0588631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2720  hypothetical protein  37.01 
 
 		 240 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00344324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10943  hypothetical protein  32.68 
 
 		 245 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2466  hypothetical protein  35.66 
 
 		 243 aa  89.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00315756  hitchhiker  0.00463895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0417  NADPH-dependent FMN reductase  32.47 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5993  hypothetical protein  29.14 
 
 		 205 aa  86.3  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7142  hypothetical protein  29.8 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1423  hypothetical protein  30.63 
 
 		 248 aa  85.9  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2691  hypothetical protein  34.78 
 
 		 234 aa  84.3  9e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4331  manganese transport protein  31.3 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10403  hypothetical protein  33.58 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4291  hypothetical protein  27.03 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2017  hypothetical protein  26.35 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499151  normal  0.173884 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.7 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000071782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3624  hypothetical protein  37 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1442  NADPH-dependent FMN reductase  31.9 
 
 		 132 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.494715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2279  NADPH-dependent FMN reductase  25.41 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1845  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.98 
 
 		 152 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1351  NADPH-dependent FMN reductase  27.69 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1442  NADPH-dependent FMN reductase  24.34 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.103462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0133  NADPH-dependent FMN reductase  28.85 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000492716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1035  NADPH-dependent FMN reductase  24.31 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1063  NADPH-dependent FMN reductase  22.92 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1131  hypothetical protein  26.73 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1184  NADPH-dependent FMN reductase  23.94 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.44131  normal  0.152042 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1498  NADPH-dependent FMN reductase  26.81 
 
 		 185 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3141  iron-sulfur flavoprotein  23.61 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.087899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0050  NADPH-dependent FMN reductase  27.78 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1183  NADPH-dependent FMN reductase  30.25 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0954  NADPH-dependent FMN reductase  26.81 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0727  NADPH-dependent FMN reductase  29.89 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5662  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5282  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1188  NADPH-dependent FMN reductase  27.72 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.646638 
 
 
-
 
NC_002936  DET1244  NADPH-dependent FMN reductase  24.34 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5408  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.516964  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5027  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5265  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1251  NADPH-dependent FMN reductase  23.61 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5340  FMN reductase, NADPH-dependent  25.2 
 
 		 181 aa  42  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4872  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  24.39 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0677  iron-sulfur flavoprotein  29.73 
 
 		 250 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4857  NAD(P)H dehydrogenase (quinone); trp repressor-binding protein  24.39 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0857  NADPH-dependent FMN reductase  20.1 
 
 		 262 aa  41.2  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1744  NADPH-dependent FMN reductase  28.71 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0255848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>